Difference between revisions of "Team:Humboldt Berlin/Basic Part"

Line 462: Line 462:
 
</div>
 
</div>
 
<!--------------------------------------- TWO COLUMN IMG LEFT END ----------------------------------------------->
 
<!--------------------------------------- TWO COLUMN IMG LEFT END ----------------------------------------------->
−
             
+
 
 +
 
 +
<!-------------------------------------- GHOST PARTS ------------------------------------------------------------>
 +
 
 +
<div class="width-limit padding-container"style="width: 60%; margin-left:auto;margin-right:auto">
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/0/06/T--Humboldt_Berlin--warning_not-moclo.png" style="max-width:50%; margin-left: auto; margin-right: auto;"/>
 +
</div> 
 +
 
 +
<br><br>
 +
<div class="width-limit padding-container ptable" style="width: 60%; margin-left:auto;margin-right:auto">
 +
<h3 class="headline3">Our ghost (not moclo compatible) parts</h3>
 +
<table>
 +
 
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <th scope="col">Part Name</th>
 +
                                                        <th scope="col">Registry Name </th>
 +
                                                        <th scope="col">Registry Type</th>
 +
                                                        <th scope="col">Description </th>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ARS1</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984066">BBa_K2984066 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 3'UTR Arylsulfatase1 secretion signal</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-GLE</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984067">BBa_K2984067 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 3'UTR gametolysin secretion signal</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-AR</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984068">BBa_K2984068 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with AR promoter</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PETase</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984069">BBa_K2984069 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PETase</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Hyg</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984070">BBa_K2984070 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ptxD</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984071">BBa_K2984071 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-6xHistag</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984072">BBa_K2984072 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 6x histidine tag</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-3xHis tag</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984073">BBa_K2984073 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td> L0 backbone with 3x histidine tag</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-SP<sub>20</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984074">BBa_K2984074 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td> L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-YFP</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984075">BBa_K2984075 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td> L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-RbcS2</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984076">BBa_K2984076 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with RuBisCo terminator</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PsaD</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984077">BBa_K2984077 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PsaD promoter</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PsaDIntron</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984078">BBa_K2984078 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PsaDIntron</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Cah</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984079">BBa_K2984079 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Carboanhyydrase</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ble+scp</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984090">BBa_K2984090 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Bleomycin resistance</td>
 +
                                                    </tr>
 +
</table>
 +
</div>
 +
<!--------------------------------------- GHOST PART END -----------------------------------------------> 
 +
 
 +
           
 
<!--------------------------------------- TO TOP LINK ----------------------------------------------->
 
<!--------------------------------------- TO TOP LINK ----------------------------------------------->
 
                 <a href="#" class="to-top-link">
 
                 <a href="#" class="to-top-link">

Revision as of 23:00, 19 October 2019

Building Blocks

Basic Part

Part Name Registry Name Registry Type Description Fusion Sites Position in L1
L0-ARS1 BBa_K2984000 Coding L0 backbone with 3'UTR Arylsulfatase1 secretion signal B2-B2 -
L0-GLE BBa_K2984001 Coding L0 backbone with 3'UTR gametolysin secretion signal B2-B2 -
L0-RFP BBa_K2984004 Coding L0 backbone with RFP - -
L0-Paro BBa_K2984006 Coding L0 backbone with Paromomycine resistance CDS B3-B4 -
L0-amp BBa_K2984007 Coding L0 backbone with ampilicin resistance - -
L0-PsaD BBa_K2984008 Regulatory L0 backbone with PsaD promoter A1-B1 ▇
L0-AR BBa_K2984009 Regulatory L0 backbone with AR promoter A1-A3 ▇
L0 - Backbone BBa_K2984010 Plasmid L0 backbone (plasmid with RFP insert) - -
L0-PETase BBa_K2984011 Coding L0 backbone with PETase CDS B3-B4 ▇
L0-Hyg BBa_K2984012 Coding L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS B3-B4 ▇
L0-ptxD BBa_K2984013 Coding L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS B3-B4 ▇
L0-6xHis tag BBa_K2984014 Tag L0 backbone with 6x histidine tag B5-B5 ▇
L0-3xHis tag BBa_K2984015 Tag L0 backbone with 3x histidine tag B5-B5 ▇
L0-SP20 BBa_K2984016 Coding L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement B5-B5 -
L0-YFP BBa_K2984017 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B3-B4 ▇
L0-RbcS2 BBa_K2984018 Terminator L0 backbone with RuBisCo terminator B5-C1 ▇
L0-YFP BBa_K2984020 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B5-B5 -
L0-RbcS2 BBa_K2984021 Terminator L0 backbone with RuBisCo terminator B6-C1 ▇
L0-PsaD BBa_K2984022 Regulatory L0 backbone with PsaD promoter A1-A3 ▇
L0-YFP BBa_K2984024 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B4-B4 ▇
L0-AR BBa_K2984025 Regulatory L0 backbone with AR promoter A1-B1 ▇
L0-ptxD BBa_K2984026 Coding L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS B3-B3 ▇
L0-Linker BBa_K2984034 Intermediate L0 backbone with Linker sequence B2-B2 ▇
L0-Ble BBa_K2984040 Coding L0 backbone with Bleomycin resistance B1-B1 -
L0-scp BBa_K2984044 Intermediate L0 backbone with Bleomycin resistance B1-B1 -
L0-PsaDIntron BBa_K2984046 Regulatory L0 backbone with PsaDIntron A1-A3 ▇
L0-PETase BBa_K2984049 Regulatory L0 backbone with PETase B3-B3 ▇
L0-amp BBa_K2984058 Intermediate Linker L1c -> L0 - ▇
L0 Linker BBa_K2984060 Intermediate Linker L0 -> L1a - ▇
L0 Linker BBa_K2984061 Intermediate Linker L0 -> L1b - ▇
L2 Linker BBa_K2984062 Intermediate Linker L2 -> L1b - ▇
Linker sequence BBa_K2984034 Intermediate Linker sequence B2-B2 ▇



Here's how our color-code works



Promoter 5' UTR CDS CDS/Tag Terminator Linker
A1/A3
A1/B1		 B1/B2 B3/B4
B3/B3		 B4/B4 B5/C1
(B6/C1)		 -
▇ ▇ ▇ ▇ ▇ ▇

Our color-code for L0 parts


Our ghost (not moclo compatible) parts

Part Name Registry Name Registry Type Description
L0-ARS1 BBa_K2984066 Coding L0 backbone with 3'UTR Arylsulfatase1 secretion signal
L0-GLE BBa_K2984067 Coding L0 backbone with 3'UTR gametolysin secretion signal
L0-AR BBa_K2984068 Coding L0 backbone with AR promoter
L0-PETase BBa_K2984069 Coding L0 backbone with PETase
L0-Hyg BBa_K2984070 Coding L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS
L0-ptxD BBa_K2984071 Coding L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS
L0-6xHistag BBa_K2984072 Coding L0 backbone with 6x histidine tag
L0-3xHis tag BBa_K2984073 Coding L0 backbone with 3x histidine tag
L0-SP20 BBa_K2984074 Coding L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement
L0-YFP BBa_K2984075 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS
L0-RbcS2 BBa_K2984076 Coding L0 backbone with RuBisCo terminator
L0-PsaD BBa_K2984077 Coding L0 backbone with PsaD promoter
L0-PsaDIntron BBa_K2984078 Coding L0 backbone with PsaDIntron
L0-Cah BBa_K2984079 Coding L0 backbone with Carboanhyydrase
L0-ble+scp BBa_K2984090 Coding L0 backbone with Bleomycin resistance
Go to top