Difference between revisions of "Team:Humboldt Berlin/Basic Part"

Line 204: Line 204:
 
                                                         <td>L0 backbone with PETase CDS </td>
 
                                                         <td>L0 backbone with PETase CDS </td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
−
                                                         <td> style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
+
                                                         <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 213: Line 213:
 
                                                         <td>L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS </td>
 
                                                         <td>L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS </td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
−
                                                         <td> style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
+
                                                         <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 222: Line 222:
 
                                                         <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS </td>
 
                                                         <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS </td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
−
                                                         <td> style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
+
                                                         <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 231: Line 231:
 
                                                         <td>L0 backbone with 6x histidine tag</td>
 
                                                         <td>L0 backbone with 6x histidine tag</td>
 
                                                         <td>B5-B5</td>
 
                                                         <td>B5-B5</td>
−
                                                         <td>style="color:#OA2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
+
                                                         <td style="color:#OA2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 240: Line 240:
 
                                                         <td>L0 backbone with 3x histidine tag</td>
 
                                                         <td>L0 backbone with 3x histidine tag</td>
 
                                                         <td>B5-B5</td>
 
                                                         <td>B5-B5</td>
−
                                                         <td> style="color:#OA2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
+
                                                         <td style="color:#OA2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 249: Line 249:
 
                                                         <td>L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement</td>
 
                                                         <td>L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement</td>
 
                                                         <td>B5-B5</td>
 
                                                         <td>B5-B5</td>
−
                                                         <td> style="color:#OA2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
+
                                                         <td style="color:#OA2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 258: Line 258:
 
                                                         <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
 
                                                         <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
−
                                                         <td> style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
+
                                                         <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 267: Line 267:
 
                                                         <td>L0 backbone with RuBisCo terminator </td>
 
                                                         <td>L0 backbone with RuBisCo terminator </td>
 
                                                         <td>B5-C1</td>
 
                                                         <td>B5-C1</td>
−
                                                         <td> style="color:#OA2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
+
                                                         <td style="color:#OA2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 285: Line 285:
 
                                                         <td>L0 backbone with RuBisCo terminator </td>
 
                                                         <td>L0 backbone with RuBisCo terminator </td>
 
                                                         <td>B6-C1</td>
 
                                                         <td>B6-C1</td>
−
                                                         <td> style="color:#OA2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
+
                                                         <td style="color:#OA2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 303: Line 303:
 
                                                         <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
 
                                                         <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
 
                                                         <td>B4-B4</td>
 
                                                         <td>B4-B4</td>
−
                                                         <td>style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td><!hbl>
+
                                                         <td style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td><!hbl>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 321: Line 321:
 
                                                         <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS </td>
 
                                                         <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS </td>
 
                                                         <td>B3-B3</td>
 
                                                         <td>B3-B3</td>
−
                                                         <td> style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
+
                                                         <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
 
                                                      
 
                                                      

Revision as of 15:31, 19 October 2019

Building Blocks

Basic Part

Part Name Registry Name Registry Type Description Fusion Sites Position in L1
L0-ARS1 BBa_K2984000 Coding L0 backbone with 3'UTR Arylsulfatase1 secretion signal B2-B2 -
L0-GLE BBa_K2984001 Coding L0 backbone with 3'UTR gametolysin secretion signal B2-B2 -
L0-RFP BBa_K2984004 Coding L0 backbone with RFP - -
L0-Paro BBa_K2984006 Coding L0 backbone with Paromomycine resistance CDS B3-B4 -
L0-amp BBa_K2984007 Coding L0 backbone with ampilicin resistance - -
L0-PsaD BBa_K2984008 Regulatory L0 backbone with PsaD promoter A1-B1 ▇
L0-AR BBa_K2984009 Regulatory L0 backbone with AR promoter A1-A3 ▇
L0 - Backbone BBa_K2984010 Plasmid L0 backbone (plasmid with RFP insert) - ▇
L0-PETase BBa_K2984011 Coding L0 backbone with PETase CDS B3-B4 ▇
L0-Hyg BBa_K2984012 Coding L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS B3-B4 ▇
L0-ptxD BBa_K2984013 Coding L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS B3-B4 ▇
L0-6xHis tag BBa_K2984014 Tag L0 backbone with 6x histidine tag B5-B5 ▇
L0-3xHis tag BBa_K2984015 Tag L0 backbone with 3x histidine tag B5-B5 ▇
L0-SP20 BBa_K2984016 Coding L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement B5-B5 ▇
L0-YFP BBa_K2984017 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B3-B4 ▇
L0-RbcS2 BBa_K2984018 Terminator L0 backbone with RuBisCo terminator B5-C1 ▇
L0-YFP BBa_K2984020 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B5-B5 -
L0-RbcS2 BBa_K2984021 Terminator L0 backbone with RuBisCo terminator B6-C1 ▇
L0-PsaD BBa_K2984022 Regulatory L0 backbone with PsaD promoter A1-A3 ▇
L0-YFP BBa_K2984024 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B4-B4 ▇
L0-AR BBa_K2984025 Regulatory L0 backbone with AR promoter A1-B1 ▇
L0-ptxD BBa_K2984026 Coding L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS B3-B3 ▇
L0-Linker BBa_K2984034 Intermediate L0 backbone with Linker sequence B2-B2 -
L0-Ble BBa_K2984040 Coding L0 backbone with Bleomycin resistance B1-B1 -
L0-scp BBa_K2984044 Intermediate L0 backbone with Bleomycin resistance B1-B1 -
L0-PsaDIntron BBa_K2984046 Regulatory L0 backbone with PsaDIntron A1-A3 ▇
L0-PETase BBa_K2984049 Regulatory L0 backbone with PETase B3-B3 ▇
L0-amp BBa_K2984058 Intermediate Linker L1c -> L0 - -
L0 Linker BBa_K2984060 Intermediate Linker L0 -> L1a - -
L0 Linker BBa_K2984061 Intermediate Linker L0 -> L1b - -
L2 Linker BBa_K2984062 Intermediate Linker L2 -> L1b - -
Linker sequence BBa_K2984034 Intermediate Linker sequence B2-B2 -



Here's how our color-code works



Promoter 5' UTR CDS CDS/Tag Terminator
A1/A3
A1/B1		 B1/B2 B3/B4
B3/B3		 B4/B4 B5/C1
(B6/C1)
▇ ▇ ▇ ▇ ▇

Our color-code for L0 parts
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