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                     <h2 style="margin: 0;padding: 10px 0;">Project Summary</h2>
 
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                     <p style="margin: 0">Contact-dependent signaling is critical for multicellular biological
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                     <p style="margin: 0">abstract abstract abstract abstract abstract abstract abstract abstract abstract abstract abstract abstract abstract abstract abstract abstract due sep 5 due sep 5 due sep 5 due sep 5 due sep 5 due sep 5 due sep 5 due sep 5 due sep 5 due sep 5 due sep 5 due sep 5
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                            events, yet customizing contact-dependent signal transduction between
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                            cells remains challenging. Here we have developed the ENABLE toolbox, a
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                            complete set of transmembrane binary logic gates. Each gate consists of
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                            3 layers: Receptor, Amplifier, and Combiner. We first optimized synthetic
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                            Notch receptors to enable cells to respond to different signals across the
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                            membrane reliably. These signals, individually amplified intracellularly by
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                            transcription, are further combined for computing. Our engineered zinc finger-based
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                            transcription factors perform binary computation and output designed products.
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                            In summary, we have combined spatially different signals in mammalian cells,
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                            and revealed new potentials for biological oscillators, tissue engineering,
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                            cancer treatments, bio-computing, etc. ENABLE is a toolbox for constructing
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                            contact-dependent signaling networks in mammals. The 3-layer design principle
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                            underlying ENABLE empowers any future development of transmembrane logic circuits,
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                            thus contributes a foundational advance to Synthetic Biology.
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                             <a href="https://2018.igem.org/Team:Fudan" target="_blank"><img alt="2018 Team:Fudan logo white" class="col s3 m6 l3" style="position:relative; padding: 0 0.3rem; margin:-0.15rem 0; left: -0.45rem;" src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/7/73/T--Fudan--teamLogoWhite.png">
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                             </a><a href="http://www.fudan.edu.cn/en/" target="_blank"><img class="col s3 m6 l3" alt="Fudan University" src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/f/f7/T--Fudan--schoolLogo.png">
 
                         </a><a href="http://life.fudan.edu.cn/" target="_blank"><img class="col s3 m6 l3" style="margin-bottom: 4%;/* 该图比其他小一点，排版需要 */" alt="School of Life Sciences, Fudan University" src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/1/1d/T--Fudan--schoolOfLifeSciencesIcon.png">
 
                         </a><a href="http://life.fudan.edu.cn/" target="_blank"><img class="col s3 m6 l3" style="margin-bottom: 4%;/* 该图比其他小一点，排版需要 */" alt="School of Life Sciences, Fudan University" src="https://static.igem.org/mediawiki/2018/1/1d/T--Fudan--schoolOfLifeSciencesIcon.png">
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                                        <li><a href="/Team:Fudan-TSI/HP">Why we do this</a></li>
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Revision as of 14:18, 29 August 2019

2019 Team:Fudan-TSI Composite_Part

Composite parts

This year, our BioBrick submission includes 7 versions of SynNotch receptors, with our favorite being αCD19-mN1c-tTAA.

Composite parts

This year, our BioBrick submission includes 7 versions of SynNotch receptors, with our favorite being αCD19-mN1c-tTAA.

Part:BBa_K2549021 αCD19-mN1c-tTAA

Introduction

This year we have provided 7 versions of SynNotch receptors in our BioBrick submission, enabling others to wire their contact-dependent signal transduction in mammalian cells. Multiple combinations of extracellular domains, transmembrane core regions and intracellular domains make it even easier for others to readily assemble their own desirable genetic circuits.

Among the 7 SynNotch receptors, our favorite one is αCD19-mN1c-tTAA (BBa_K2549021)
part BBa_K2549021

How αCD19-mN1c-tTAA works

It receives ligand-dependent signal via the CD19 scFv and undergoes a cleavage process in which the tTA advance is released, then entering into the nucleus to activate the expression of TRE3GV promotor. Thus it can be served as a signal input module.

Advantages of αCD19-mN1c-tTAA

We have conducted flow cytometry experiments to test our SynNotch receptors and after testing, αCD19-mN1c-tTAA have stood out for showing the highest signal-to-noise ratio. We have also discovered that it has the highest activation ratio when activated by surface-expressed CD19 antigen. Moreover, it also shows only a few amount of false activation which can be tolerated. As it performs great modularity and has a great potential to be utilized by others to assemble their own CD19-dependent signal transduction module, this especially enables the possibility of the clinical application of SynNotch receptors.

Figure 1. Flow cytometry characterization of SynNotch receptors. TRE3GV-EGFP circuit was set to indicate the activation level of SynNotch receptors. It is shown that αCD19-mN1c-tTAA has the highest signal-to-noise ratio.

For more details, please check our parts collection page.

project summary

Project Summary

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