Difference between revisions of "Team:Humboldt Berlin/Experiments"

Line 101: Line 101:
 
         </div>
 
         </div>
  
−
        <section class="page-content fixed-header-content experiments width-limit">
+
<section class="page-content fixed-header-content experiments">
−
             <h2 class="page-subheadline">Protocolls</h2>
+
             <div class="protocolls-header">
−
            <!-- TODO collapse all, expand all -->
+
                <h2 class="page-subheadline">Protocolls</h2>
 +
                <div class="protocolls-buttons">
 +
                    <div class="collapse-all">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/3/3e/T--Humboldt_Berlin--ArrowDown.jpg">
 +
                        Collapse all
 +
                    </div>
 +
                    <div class="expand-all">
 +
                        <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/3/3e/T--Humboldt_Berlin--ArrowDown.jpg">
 +
                        Expand all
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
  
 
             <div class="experiments-container">
 
             <div class="experiments-container">
−
                 <div class="experiments-bar">
+
                 <div class="experiments-bar open">
 
                     <h3 class="lightgreen">Chlamydomonas Protocol</h3>
 
                     <h3 class="lightgreen">Chlamydomonas Protocol</h3>
  
Line 112: Line 123:
 
                         <div class="experiments-bar">
 
                         <div class="experiments-bar">
 
                             <h3>Media & Plates</h3>
 
                             <h3>Media & Plates</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                <p>
 +
                                    To be able to work with C. reinhardtii, you will need medium.
 +
                                    This medium can be in either liquid or solid form and is essential
 +
                                    for any experiment regarding C. reinhardtii. The media we used for
 +
                                    C. reinhardtii is TAP medium.
 +
                                </p>
 +
 +
                                <table>
 +
                                    <tr>
 +
                                        <th scope="col">Media</th>
 +
                                        <th scope="col">0,5 L</th>
 +
                                        <th scope="col">1,8L</th>
 +
                                    </tr>
 +
                                    <tr>
 +
                                        <td><b>40 x TAP/TA/TAPi</b></td>
 +
                                        <td>12,5 ml</td>
 +
                                        <td>20 ml</td>
 +
                                    </tr>
 +
                                    <tr>
 +
                                        <td><b>40 x Beijerink Salts</b></td>
 +
                                        <td>12,5 ml</td>
 +
                                        <td>20 ml</td>
 +
                                    </tr>
 +
                                    <tr>
 +
                                        <td><b>Trace Elements (revised)</b></td>
 +
                                        <td>3,5 ml</td>
 +
                                        <td>5,6 ml</td>
 +
                                    </tr>
 +
                                    <tr>
 +
                                        <td><b>H2O</b></td>
 +
                                        <td>471,5 ml</td>
 +
                                        <td>754,4 ml</td>
 +
                                    </tr>
 +
                                    <tr>
 +
                                        <td><b>For Plates: + Agar (1,8 %)</b></td>
 +
                                        <td>7,2 g</td>
 +
                                        <td>14,4 g</td>
 +
                                    </tr>
 +
                                </table>
 +
                                <p>Tap Medium should be adjusted to 7,0 - 7,2 pH and autoclaved.</p>
 +
                            </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                         <div class="experiments-bar">
 
                         <div class="experiments-bar">
 
                             <h3>Cultivation</h3>
 
                             <h3>Cultivation</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                         <div class="experiments-bar">
 
                         <div class="experiments-bar">
 
                             <h3>Transformation</h3>
 
                             <h3>Transformation</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                         <div class="experiments-bar">
 
                         <div class="experiments-bar">
 
                             <h3>Colony Screening PCR</h3>
 
                             <h3>Colony Screening PCR</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
 +
                <div class="experiments-bar open">
 +
                    <h3 class="pink">E. coli Protocols</h3>
 +
 +
                    <div class="experiments-bar-content">
 +
                        <div class="experiments-bar open">
 +
                            <h3>Cultivation</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                <div class="experiments-bar">
 +
                                    <h3>Media & Plates</h3>
 +
 +
                                    <div class="experiments-bar-content">
 +
                                        TODO
 +
                                    </div>
 +
                                </div>
 +
                                <div class="experiments-bar">
 +
                                    <h3>Overnight Cultures</h3>
 +
 +
                                    <div class="experiments-bar-content">
 +
                                        TODO
 +
                                    </div>
 +
                                </div>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="experiments-bar">
 +
                            <h3>Transformation</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="experiments-bar">
 +
                            <h3>DNA-Isolation</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
 +
                <div class="experiments-bar open">
 +
                    <h3 class="lightpurple">Synthesis Protocols</h3>
 +
 +
                    <div class="experiments-bar-content">
 +
                        <div class="experiments-bar">
 +
                            <h3>Sequence & Primer Design</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="experiments-bar">
 +
                            <h3>PCR</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="experiments-bar">
 +
                            <h3>Digestion</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="experiments-bar">
 +
                            <h3>Ligation</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
 +
                <div class="experiments-bar open">
 +
                    <h3 class="greyblue">General</h3>
 +
 +
                    <div class="experiments-bar-content">
 +
                        <div class="experiments-bar">
 +
                            <h3>Gel Electrophoresis</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="experiments-bar">
 +
                            <h3>Protein Expression: SDS-page</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
 +
                <div class="experiments-bar open">
 +
                    <h3 class="lightblue">Workflow</h3>
 +
 +
                    <div class="experiments-bar-content">
 +
                        <div class="experiments-bar">
 +
                            <h3>Plasmid assembly</h3>
 +
 +
                            <div class="experiments-bar-content">
 +
                                TODO
 +
                            </div>
 
                         </div>
 
                         </div>
 
                     </div>
 
                     </div>

Revision as of 06:18, 1 October 2019

Experiments

Experiments

Protocolls

Collapse all
Expand all

Chlamydomonas Protocol

Media & Plates

To be able to work with C. reinhardtii, you will need medium. This medium can be in either liquid or solid form and is essential for any experiment regarding C. reinhardtii. The media we used for C. reinhardtii is TAP medium.

Media 0,5 L 1,8L
40 x TAP/TA/TAPi 12,5 ml 20 ml
40 x Beijerink Salts 12,5 ml 20 ml
Trace Elements (revised) 3,5 ml 5,6 ml
H2O 471,5 ml 754,4 ml
For Plates: + Agar (1,8 %) 7,2 g 14,4 g

Tap Medium should be adjusted to 7,0 - 7,2 pH and autoclaved.

Cultivation

TODO

Transformation

TODO

Colony Screening PCR

TODO

E. coli Protocols

Cultivation

Media & Plates

TODO

Overnight Cultures

TODO

Transformation

TODO

DNA-Isolation

TODO

Synthesis Protocols

Sequence & Primer Design

TODO

PCR

TODO

Digestion

TODO

Ligation

TODO

General

Gel Electrophoresis

TODO

Protein Expression: SDS-page

TODO

Workflow

Plasmid assembly

TODO