Difference between revisions of "Team:Humboldt Berlin/Basic Part"

 
(22 intermediate revisions by 2 users not shown)
Line 100: Line 100:
  
 
             <!-- HEADLINE TEXT -->
 
             <!-- HEADLINE TEXT -->
−
             <h1 class="page-headline description" style="color:#ffffff">Basic Part</h1>
+
             <h1 class="page-headline description" style="color:#ffffff">Basic Parts</h1>
 
         </div>
 
         </div>
  
Line 114: Line 114:
  
 
  <div class="width-limit">
 
  <div class="width-limit">
 +
<div class="width-limit padding-container ptable" style="width: 60%; margin-left:auto;margin-right:auto">
 
       <p><table>
 
       <p><table>
 +
<!------------------------------------------ Basic L0 parts ---------------------------------------->
 +
                                                 
 +
 
                                                     <tr>
 
                                                     <tr>
 
                                                         <th scope="col">Part Name</th>
 
                                                         <th scope="col">Part Name</th>
Line 122: Line 126:
 
                                                         <th scope="col">Fusion Sites </th>
 
                                                         <th scope="col">Fusion Sites </th>
 
                                                         <th scope="col">Position in L1</th>
 
                                                         <th scope="col">Position in L1</th>
−
                                                    </tr>
 
−
 
−
                                                    <tr>
 
−
                                                        <td>L0 - Backbone  </td>
 
−
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984010">BBa_K2984010 </a> </td>
 
−
                                                        <td>Plasmid </td>
 
−
                                                        <td>L0 backbone (plasmid with RFP insert)  </td>
 
−
                                                        <td>-</td>
 
−
                                                        <td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td>
 
−
                                                    </tr>
 
−
 
−
                                                    <tr>
 
−
                                                        <td>L0-AR</td>
 
−
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984009">BBa_K2984009 </a> </td>
 
−
                                                        <td>Regulatory </td>
 
−
                                                        <td>L0 backbone with AR promoter  </td>
 
−
                                                        <td>A1-A3</td>
 
−
                                                        <td style="color:#FFD185;text-align:center">&#9607;</td>
 
−
                                                    </tr>
 
−
 
−
                                                    <tr>
 
−
                                                        <td>L0-AR</td>
 
−
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984025">BBa_K2984025 </a> </td>
 
−
                                                        <td>Regulatory </td>
 
−
                                                        <td>L0 backbone with AR promoter  </td>
 
−
                                                        <td>A1-B1</td>
 
−
                                                        <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td>
 
−
                                                    </tr>
 
−
 
−
                                                    <tr>
 
−
                                                        <td>L0-PsaD</td>
 
−
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984022">BBa_K2984022 </a> </td>
 
−
                                                        <td>Regulatory </td>
 
−
                                                        <td>L0 backbone with PsaD promoter  </td>
 
−
                                                        <td>A1-A3</td>
 
−
                                                        <td style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td>
 
−
                                                    </tr>
 
−
 
−
                                                    <tr>
 
−
                                                        <td>L0-PsaD</td>
 
−
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984008">BBa_K2984008 </a> </td>
 
−
                                                        <td>Regulatory </td>
 
−
                                                        <td>L0 backbone with PsaD promoter  </td>
 
−
                                                        <td>A1-B1</td>
 
−
                                                        <td style="color:#0A2187;text-align:center">&#9607;</td>
 
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 188: Line 147:
  
 
                                                     <tr>
 
                                                     <tr>
−
                                                         <td>L0-PETase</td>
+
                                                         <td>L0-RFP</td>
−
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K29840011">BBa_K2984011 </a> </td>
+
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984004">BBa_K2984004</a> </td>
 
                                                         <td>Coding</td>
 
                                                         <td>Coding</td>
−
                                                         <td>L0 backbone with PETase CDS </td>
+
                                                         <td>L0 backbone with RFP</td>
−
                                                         <td>B3-B4</td>
+
                                                         <td> - </td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
 
                                                     <tr>
 
                                                     <tr>
−
                                                         <td>L0-Hyg</td>
+
                                                         <td>L0-Paro</td>
−
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K29840012">BBa_K2984012 </a> </td>
+
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984006">BBa_K2984006 </a> </td>
 
                                                         <td>Coding</td>
 
                                                         <td>Coding</td>
−
                                                         <td>L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS </td>
+
                                                         <td>L0 backbone with Paromomycine resistance CDS </td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                         <td>-</td>
Line 206: Line 165:
  
 
                                                     <tr>
 
                                                     <tr>
−
                                                         <td>L0-Paro</td>
+
                                                         <td>L0-amp</td>
−
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K29840006">BBa_K2984006 </a> </td>
+
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984007">BBa_K2984007</a> </td>
 
                                                         <td>Coding</td>
 
                                                         <td>Coding</td>
−
                                                         <td>L0 backbone with Paromomycine resistance CDS </td>
+
                                                         <td>L0 backbone with ampilicin resistance</td>
−
                                                         <td>B3-B4</td>
+
                                                         <td> -</td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
 
                                                     <tr>
 
                                                     <tr>
−
                                                         <td>L0-ptxD</td>
+
                                                         <td>L0-PsaD</td>
−
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K29840026">BBa_K2984026 </a> </td>
+
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984008">BBa_K2984008 </a> </td>
−
                                                         <td>Coding</td>
+
                                                         <td>Regulatory </td>
−
                                                         <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS </td>
+
                                                         <td>L0 backbone with PsaD promoter  </td>
−
                                                         <td>B3-B3</td>
+
                                                         <td>A1-B1</td>
−
                                                         <td>-</td>
+
                                                         <td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td<!grün>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
 
                                                     <tr>
 
                                                     <tr>
−
                                                         <td>L0-ptxD</td>
+
                                                         <td>L0-AR</td>
−
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984013">BBa_K2984013 </a> </td>
+
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984009">BBa_K2984009 </a> </td>
−
                                                         <td>Coding</td>
+
                                                         <td>Regulatory </td>
−
                                                         <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS </td>
+
                                                         <td>L0 backbone with AR promoter  </td>
−
                                                         <td>B3-B4</td>
+
                                                        <td>A1-A3</td>
 +
                                                        <td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td><!grün>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0 - Backbone  </td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984010">BBa_K2984010 </a> </td>
 +
                                                        <td>Plasmid </td>
 +
                                                        <td>L0 backbone (plasmid with RFP insert)  </td>
 +
                                                         <td>-</td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
 
                                                     <tr>
 
                                                     <tr>
−
                                                         <td>L0-YFP</td>
+
                                                         <td>L0-PETase</td>
−
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984017">BBa_K2984017 </a> </td>
+
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984011">BBa_K2984011 </a> </td>
 
                                                         <td>Coding</td>
 
                                                         <td>Coding</td>
−
                                                         <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
+
                                                         <td>L0 backbone with PETase CDS </td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
 
                                                         <td>B3-B4</td>
−
                                                         <td>-</td>
+
                                                         <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
 
                                                     <tr>
 
                                                     <tr>
−
                                                         <td>L0-YFP</td>
+
                                                         <td>L0-Hyg</td>
−
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984024">BBa_K2984024 </a> </td>
+
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984012">BBa_K2984012 </a> </td>
 
                                                         <td>Coding</td>
 
                                                         <td>Coding</td>
−
                                                         <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
+
                                                         <td>L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS </td>
−
                                                         <td>B4-B4</td>
+
                                                         <td>B3-B4</td>
−
                                                         <td>-</td>
+
                                                         <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
 
                                                     <tr>
 
                                                     <tr>
−
                                                         <td>L0-YFP</td>
+
                                                         <td>L0-ptxD</td>
−
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984020">BBa_K2984020 </a> </td>
+
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984013">BBa_K2984013 </a> </td>
 
                                                         <td>Coding</td>
 
                                                         <td>Coding</td>
−
                                                         <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
+
                                                         <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS </td>
−
                                                         <td>B5-B5</td>
+
                                                         <td>B3-B4</td>
−
                                                         <td>-</td>
+
                                                         <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 265: Line 233:
 
                                                         <td>L0 backbone with 6x histidine tag</td>
 
                                                         <td>L0 backbone with 6x histidine tag</td>
 
                                                         <td>B5-B5</td>
 
                                                         <td>B5-B5</td>
−
                                                         <td>-</td>
+
                                                         <td style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td><!hellblau>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 274: Line 242:
 
                                                         <td>L0 backbone with 3x histidine tag</td>
 
                                                         <td>L0 backbone with 3x histidine tag</td>
 
                                                         <td>B5-B5</td>
 
                                                         <td>B5-B5</td>
−
                                                         <td>-</td>
+
                                                         <td style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td><!hellblau>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 284: Line 252:
 
                                                         <td>B5-B5</td>
 
                                                         <td>B5-B5</td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                         <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-YFP</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984017">BBa_K2984017 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
 +
                                                        <td>B3-B4</td>
 +
                                                        <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
  
Line 292: Line 269:
 
                                                         <td>L0 backbone with RuBisCo terminator </td>
 
                                                         <td>L0 backbone with RuBisCo terminator </td>
 
                                                         <td>B5-C1</td>
 
                                                         <td>B5-C1</td>
 +
                                                        <td style="color:#0A2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
 +
                                                    </tr>
 +
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-YFP</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984020">BBa_K2984020 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
 +
                                                        <td>B5-B5</td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
−
<tr>
+
 
 +
                                                    <tr>
 
                                                         <td>L0-RbcS2</td>
 
                                                         <td>L0-RbcS2</td>
 
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984021">BBa_K2984021</a> </td>
 
                                                         <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984021">BBa_K2984021</a> </td>
Line 300: Line 287:
 
                                                         <td>L0 backbone with RuBisCo terminator </td>
 
                                                         <td>L0 backbone with RuBisCo terminator </td>
 
                                                         <td>B6-C1</td>
 
                                                         <td>B6-C1</td>
 +
                                                        <td style="color:#0A2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
 +
                                                    </tr>
 +
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PsaD</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984022">BBa_K2984022 </a> </td>
 +
                                                        <td>Regulatory </td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PsaD promoter  </td>
 +
                                                        <td>A1-A3</td>
 +
                                                        <td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td><!grün>
 +
                                                    </tr>
 +
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-YFP</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984024">BBa_K2984024 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
 +
                                                        <td>B4-B4</td>
 +
                                                        <td style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td><!hbl>
 +
                                                    </tr>
 +
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-AR</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984025">BBa_K2984025 </a> </td>
 +
                                                        <td>Regulatory </td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with AR promoter  </td>
 +
                                                        <td>A1-B1</td>
 +
                                                        <td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td><!grün>
 +
                                                    </tr>
 +
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ptxD</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K29840026">BBa_K2984026 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS </td>
 +
                                                        <td>B3-B3</td>
 +
                                                        <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                   
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Linker</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984034">BBa_K2984034</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Linker sequence </td>
 +
                                                        <td>B2-B2</td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Ble</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984040">BBa_K2984040</a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Bleomycin resistance </td>
 +
                                                        <td>B1-B1</td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                         <td>-</td>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-scp</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984044">BBa_K2984044</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with self-cleaving resistance </td>
 +
                                                        <td>B1-B1</td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                       
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PsaDIntron</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984046">BBa_K2984046</a> </td>
 +
                                                        <td>Regulatory</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PsaDIntron</td>
 +
                                                        <td> A1-A3</td>
 +
                                                        <td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td><!grün>
 +
                                                    </tr>                                             
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PETase</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984049">BBa_K2984049</a> </td>
 +
                                                        <td>Regulatory</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PETase</td>
 +
                                                        <td>B3-B3</td>
 +
                                                        <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                 
 +
 +
                                                   
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-amp</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984058">BBa_K2984058</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>Linker L1c -> L0</td>
 +
                                                        <td> - </td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0 Linker</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984060">BBa_K2984060</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>Linker L0 -> L1a</td>
 +
                                                        <td> - </td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0 Linker</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984061">BBa_K2984061</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>Linker L0 -> L1b</td>
 +
                                                        <td> - </td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L2 Linker</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984062">BBa_K2984062</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>Linker L2 -> L1b</td>
 +
                                                        <td> - </td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                   
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>Linker sequence</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984034">BBa_K2984034</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>Linker sequence</td>
 +
                                                        <td> B2-B2 </td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
 
                                                 </table>
 
                                                 </table>
−
</div>
+
 
 +
</div>  
 +
 
 +
</br>
 +
             
 
  <!------------------------------------------ TWO COLUMN IMG LEFT -------------------------------------------------->
 
  <!------------------------------------------ TWO COLUMN IMG LEFT -------------------------------------------------->
−
<div class="width-limit padding-container" style="width: 60%; margin-left:auto;margin-right:auto">
+
<div class="width-limit padding-container" >
 
</br></br>
 
</br></br>
 
                     <h3  class="headline3">Here's how our color-code works</h3>
 
                     <h3  class="headline3">Here's how our color-code works</h3>
Line 312: Line 426:
 
                              
 
                              
 
</div>
 
</div>
−
<div class="width-limit padding-container"style="width: 60%; margin-left:auto;margin-right:auto">
+
<div class="two-columns no-margin-top">
 
                           </br>
 
                           </br>
 +
<div>
 
                         <p>
 
                         <p>
 
                           <table>
 
                           <table>
 
   <tr>
 
   <tr>
−
                                                      <th scope="col">Promoter</th>
+
<th scope="col">Promoter</th>
−
                                                        <th scope="col">5' UTR</th>
+
<th scope="col">5' UTR</th>
 
<th scope="col">CDS</th>
 
<th scope="col">CDS</th>
 
<th scope="col">CDS/Tag</th>
 
<th scope="col">CDS/Tag</th>
 
<th scope="col">Terminator</th>
 
<th scope="col">Terminator</th>
 +
<th scope="col">Linker</th>
 
                                                     </tr>
 
                                                     </tr>
 
<tr>
 
<tr>
Line 329: Line 445:
 
<td style="text-align:center">B4/B4</td>
 
<td style="text-align:center">B4/B4</td>
 
<td style="text-align:center">B5/C1</br>(B6/C1)</td>
 
<td style="text-align:center">B5/C1</br>(B6/C1)</td>
 +
<td style="text-align:center">-</td>
 
</tr>
 
</tr>
 
<tr>
 
<tr>
Line 336: Line 453:
 
  <td style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td>
 
  <td style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td>
 
<td style="color:#0A2187;text-align:center">&#9607;</td>
 
<td style="color:#0A2187;text-align:center">&#9607;</td>
 +
<td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td>
 
</tr>
 
</tr>
 
</table>
 
</table>
−
                         </p>
+
                         </p></div>
 +
<div>
 
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/6/69/T--Humboldt_Berlin--color-code_parts.png" alt="Our color-code for L0 parts" />
 
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/6/69/T--Humboldt_Berlin--color-code_parts.png" alt="Our color-code for L0 parts" />
 
                     </div>
 
                     </div>
−
 
+
</div>
 
<!--------------------------------------- TWO COLUMN IMG LEFT END ----------------------------------------------->
 
<!--------------------------------------- TWO COLUMN IMG LEFT END ----------------------------------------------->
−
             
+
 
 +
 
 +
<!-------------------------------------- GHOST PARTS ------------------------------------------------------------>
 +
 
 +
<div class="width-limit padding-container"style="width: 60%; margin-left:auto;margin-right:auto">
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/0/06/T--Humboldt_Berlin--warning_not-moclo.png" style="max-width:50%; margin-left: auto; margin-right: auto;"/>
 +
</div> 
 +
 
 +
<br><br>
 +
<div class="width-limit padding-container ptable" style="width: 60%; margin-left:auto;margin-right:auto">
 +
<h3 class="headline3">Our ghost (not moclo compatible) parts &#x1f47b;</h3>
 +
<table>
 +
 
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <th scope="col">Part Name</th>
 +
                                                        <th scope="col">Registry Name </th>
 +
                                                        <th scope="col">Registry Type</th>
 +
                                                        <th scope="col">Description </th>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ARS1</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984066">BBa_K2984066 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 3'UTR Arylsulfatase1 secretion signal</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-GLE</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984067">BBa_K2984067 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 3'UTR gametolysin secretion signal</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-AR</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984068">BBa_K2984068 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with AR promoter</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PETase</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984069">BBa_K2984069 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PETase</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Hyg</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984070">BBa_K2984070 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ptxD</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984071">BBa_K2984071 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-6xHistag</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984072">BBa_K2984072 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 6x histidine tag</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-3xHis tag</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984073">BBa_K2984073 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td> L0 backbone with 3x histidine tag</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-SP<sub>20</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984074">BBa_K2984074 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td> L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-YFP</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984075">BBa_K2984075 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td> L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-RbcS2</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984076">BBa_K2984076 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with RuBisCo terminator</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PsaD</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984077">BBa_K2984077 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PsaD promoter</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PsaDIntron</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984078">BBa_K2984078 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PsaDIntron</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Cah</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984079">BBa_K2984079 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Carboanhyydrase</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ble+scp</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984090">BBa_K2984090 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Bleomycin resistance</td>
 +
                                                    </tr>
 +
</table>
 +
</div>
 +
<!--------------------------------------- GHOST PART END -----------------------------------------------> 
 +
 
 +
           
 
<!--------------------------------------- TO TOP LINK ----------------------------------------------->
 
<!--------------------------------------- TO TOP LINK ----------------------------------------------->
 
                 <a href="#" class="to-top-link">
 
                 <a href="#" class="to-top-link">
Line 349: Line 584:
 
                 </a>
 
                 </a>
 
                 <!--------------------------------------- TO TOP LINK END ------------------------------------------->
 
                 <!--------------------------------------- TO TOP LINK END ------------------------------------------->
−
 
+
</section>
 
     <!------------------------------------------ FOOTER ---------------------------------------->
 
     <!------------------------------------------ FOOTER ---------------------------------------->
 
     <div class="footer-container">
 
     <div class="footer-container">

Latest revision as of 14:00, 21 October 2019

Building Blocks

Basic Parts

Part Name Registry Name Registry Type Description Fusion Sites Position in L1
L0-ARS1 BBa_K2984000 Coding L0 backbone with 3'UTR Arylsulfatase1 secretion signal B2-B2 -
L0-GLE BBa_K2984001 Coding L0 backbone with 3'UTR gametolysin secretion signal B2-B2 -
L0-RFP BBa_K2984004 Coding L0 backbone with RFP - -
L0-Paro BBa_K2984006 Coding L0 backbone with Paromomycine resistance CDS B3-B4 -
L0-amp BBa_K2984007 Coding L0 backbone with ampilicin resistance - -
L0-PsaD BBa_K2984008 Regulatory L0 backbone with PsaD promoter A1-B1 ▇
L0-AR BBa_K2984009 Regulatory L0 backbone with AR promoter A1-A3 ▇
L0 - Backbone BBa_K2984010 Plasmid L0 backbone (plasmid with RFP insert) - -
L0-PETase BBa_K2984011 Coding L0 backbone with PETase CDS B3-B4 ▇
L0-Hyg BBa_K2984012 Coding L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS B3-B4 ▇
L0-ptxD BBa_K2984013 Coding L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS B3-B4 ▇
L0-6xHis tag BBa_K2984014 Tag L0 backbone with 6x histidine tag B5-B5 ▇
L0-3xHis tag BBa_K2984015 Tag L0 backbone with 3x histidine tag B5-B5 ▇
L0-SP20 BBa_K2984016 Coding L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement B5-B5 -
L0-YFP BBa_K2984017 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B3-B4 ▇
L0-RbcS2 BBa_K2984018 Terminator L0 backbone with RuBisCo terminator B5-C1 ▇
L0-YFP BBa_K2984020 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B5-B5 -
L0-RbcS2 BBa_K2984021 Terminator L0 backbone with RuBisCo terminator B6-C1 ▇
L0-PsaD BBa_K2984022 Regulatory L0 backbone with PsaD promoter A1-A3 ▇
L0-YFP BBa_K2984024 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B4-B4 ▇
L0-AR BBa_K2984025 Regulatory L0 backbone with AR promoter A1-B1 ▇
L0-ptxD BBa_K2984026 Coding L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS B3-B3 ▇
L0-Linker BBa_K2984034 Intermediate L0 backbone with Linker sequence B2-B2 ▇
L0-Ble BBa_K2984040 Coding L0 backbone with Bleomycin resistance B1-B1 -
L0-scp BBa_K2984044 Intermediate L0 backbone with self-cleaving resistance B1-B1 -
L0-PsaDIntron BBa_K2984046 Regulatory L0 backbone with PsaDIntron A1-A3 ▇
L0-PETase BBa_K2984049 Regulatory L0 backbone with PETase B3-B3 ▇
L0-amp BBa_K2984058 Intermediate Linker L1c -> L0 - ▇
L0 Linker BBa_K2984060 Intermediate Linker L0 -> L1a - ▇
L0 Linker BBa_K2984061 Intermediate Linker L0 -> L1b - ▇
L2 Linker BBa_K2984062 Intermediate Linker L2 -> L1b - ▇
Linker sequence BBa_K2984034 Intermediate Linker sequence B2-B2 ▇



Here's how our color-code works



Promoter 5' UTR CDS CDS/Tag Terminator Linker
A1/A3
A1/B1		 B1/B2 B3/B4
B3/B3		 B4/B4 B5/C1
(B6/C1)		 -
▇ ▇ ▇ ▇ ▇ ▇

Our color-code for L0 parts


Our ghost (not moclo compatible) parts 👻

Part Name Registry Name Registry Type Description
L0-ARS1 BBa_K2984066 Coding L0 backbone with 3'UTR Arylsulfatase1 secretion signal
L0-GLE BBa_K2984067 Coding L0 backbone with 3'UTR gametolysin secretion signal
L0-AR BBa_K2984068 Coding L0 backbone with AR promoter
L0-PETase BBa_K2984069 Coding L0 backbone with PETase
L0-Hyg BBa_K2984070 Coding L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS
L0-ptxD BBa_K2984071 Coding L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS
L0-6xHistag BBa_K2984072 Coding L0 backbone with 6x histidine tag
L0-3xHis tag BBa_K2984073 Coding L0 backbone with 3x histidine tag
L0-SP20 BBa_K2984074 Coding L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement
L0-YFP BBa_K2984075 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS
L0-RbcS2 BBa_K2984076 Coding L0 backbone with RuBisCo terminator
L0-PsaD BBa_K2984077 Coding L0 backbone with PsaD promoter
L0-PsaDIntron BBa_K2984078 Coding L0 backbone with PsaDIntron
L0-Cah BBa_K2984079 Coding L0 backbone with Carboanhyydrase
L0-ble+scp BBa_K2984090 Coding L0 backbone with Bleomycin resistance
Go to top