Difference between revisions of "Team:Humboldt Berlin/Basic Part"

(Prototype team page)
 
 
(48 intermediate revisions by 4 users not shown)
Line 3: Line 3:
  
  
−
<div class="column full_size judges-will-not-evaluate">
+
<div class="has-animations description no-js" id="container">
−
<h3>★  ALERT! </h3>
+
    <div class="container">
−
<p>This page is used by the judges to evaluate your team for the <a href="https://2019.igem.org/Judging/Medals">medal criterion</a> or <a href="https://2019.igem.org/Judging/Awards"> award listed below</a>. </p>
+
−
<p> Delete this box in order to be evaluated for this medal criterion and/or award. See more information at <a href="https://2019.igem.org/Judging/Pages_for_Awards"> Instructions for Pages for awards</a>.</p>
+
−
</div>
+
  
 +
        <!------------------------------------------ NAVIGATION -------------------------------------------------->
 +
        <!-- INFO: move the class="active" to the correct <a> Tag -->
  
−
<div class="clear"></div>
+
        <nav>
 +
            <div class="width-limit nav-content">
 +
                <div>
 +
                    <a href="/Team:Humboldt_Berlin">
 +
                        <img class="nav-logo" src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/4/41/T--Humboldt_Berlin--logo-only.png" alt="small header logo" />
 +
                    </a>
 +
                </div>
 +
                <div class="nav-right">
 +
                    <input type="checkbox" />
 +
                    <span></span>
 +
                    <span></span>
 +
                    <span></span>
  
 +
                    <div class="menu-items">
 +
                        <a href="/Team:Humboldt_Berlin">
 +
                            Home
 +
                        </a>
 +
                        <div class="devider"></div>
 +
                        <div class="item">
 +
                            <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Team">Team</a>
 +
                            <div class="submenu">
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Team">Team members</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Collaborations">Collaborations</a>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="devider"></div>
 +
                        <div class="item">
 +
                            <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Description">Project</a>
 +
                            <div class="submenu">
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Description">Description</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Design">Design</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Experiments">Experiments</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Notebook">Notebook</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Contribution">Contributions</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Results">Results</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Demonstrate">Demonstrate</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Improve">Improve</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Attributions">Attributions</a>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="devider"></div>
 +
                        <div class="item">
 +
                            <a class="active" href="/Team:Humboldt_Berlin/Parts">Parts</a>
 +
                            <div class="submenu">
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Parts">Parts overview</a>
 +
                                <a class="active" href="/Team:Humboldt_Berlin/Basic_Part">Basic parts</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Composite_Part">Composite parts</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Part_Collection">Parts collection</a>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="devider"></div>
 +
                        <div class="item">
 +
                            <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Safety">Safety</a>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="devider"></div>
 +
                        <div class="item">
 +
                            <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Human_Practices">Human Practices</a>
 +
                            <div class="submenu">
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Human_Practices">Human Practices</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Public_Engagement">Education & Engagement</a>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="devider"></div>
 +
                        <div class="item">
 +
                            <a>Awards</a>
 +
                            <div class="submenu">
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Hardware">Hardware</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Measurement">Measurement</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Model">Model</a>
 +
                                <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Plant">Plant</a>
 +
                            </div>
 +
                        </div>
 +
                        <div class="devider"></div>
 +
                        <a href="https://2019.igem.org/Team:Humboldt_Berlin/Achievements">
 +
                            For Judges
 +
                        </a>
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
            </div>
 +
        </nav>
  
 +
        <!------------------------------------------ NAVIGATION END -------------------------------------------------->
  
−
<div class="column full_size">
+
        <!------------------------------------------ HEADER-------------------------------------------------->
−
<h1>Basic Parts</h1>
+
        <div class="fixed-header-container">
−
<p>
+
            <section class="fixed-image-header">
−
A <b>basic part</b> is a functional unit of DNA that cannot be subdivided into smaller component parts. <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php/Part:BBa_R0051">BBa_R0051</a> is an example of a basic part, a promoter regulated by lambda cl.
+
                <!-- HEADER IMAGE -->
−
</p>
+
                <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/b/ba/T--Humboldt_Berlin--parts_8.jpeg" alt="Building Blocks" />
 +
            </section>
  
−
<p>Most genetically-encoded functions have not yet been converted to BioBrick parts. Thus, there are <b>many</b> opportunities to find new, cool, and important genetically encoded functions, and refine and convert the DNA encoding these functions into BioBrick standard biological parts. </p>
+
            <!-- HEADLINE TEXT -->
−
</div>
+
            <h1 class="page-headline description" style="color:#ffffff">Basic Parts</h1>
 +
        </div>
  
 +
        <!------------------------------------------ HEADER END -------------------------------------------------->
  
−
<div class="column full_size">
+
    <section class="page-content fixed-header-content">
−
<div class="highlight decoration_background">
+
       
−
<h3>Note</h3>
+
           
−
<p>This page should list all the basic parts your team has made during your project and include direct links to your Parts main pages on the Registry. <b>You must add all characterization information for your parts on Parts Main Page on the Registry.</b> You should <b>not</b> put characterization information on this page. Remember judges will only look at the first part in the list for the Best Basic Part award, so put your best part first!</p>
+
 
 +
             
 +
      <!------------------------------------------ Basic L0 parts ---------------------------------------->
 +
 
 +
 
 +
<div class="width-limit">
 +
<div class="width-limit padding-container ptable" style="width: 60%; margin-left:auto;margin-right:auto">
 +
      <p><table>
 +
<!------------------------------------------ Basic L0 parts ---------------------------------------->
 +
                                                 
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <th scope="col">Part Name</th>
 +
                                                        <th scope="col">Registry Name </th>
 +
                                                        <th scope="col">Registry Type</th>
 +
                                                        <th scope="col">Description </th>
 +
                                                        <th scope="col">Fusion Sites </th>
 +
                                                        <th scope="col">Position in L1</th>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ARS1</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984000">BBa_K2984000 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 3'UTR Arylsulfatase1 secretion signal </td>
 +
                                                        <td>B2-B2</td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-GLE</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984001">BBa_K2984001 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 3'UTR gametolysin secretion signal </td>
 +
                                                        <td>B2-B2</td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-RFP</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984004">BBa_K2984004</a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with RFP</td>
 +
                                                        <td> - </td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Paro</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984006">BBa_K2984006 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Paromomycine resistance CDS </td>
 +
                                                        <td>B3-B4</td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-amp</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984007">BBa_K2984007</a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with ampilicin resistance</td>
 +
                                                        <td> -</td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PsaD</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984008">BBa_K2984008 </a> </td>
 +
                                                        <td>Regulatory </td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PsaD promoter  </td>
 +
                                                        <td>A1-B1</td>
 +
                                                        <td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td<!grün>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-AR</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984009">BBa_K2984009 </a> </td>
 +
                                                        <td>Regulatory </td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with AR promoter  </td>
 +
                                                        <td>A1-A3</td>
 +
                                                        <td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td><!grün>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0 - Backbone  </td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984010">BBa_K2984010 </a> </td>
 +
                                                        <td>Plasmid </td>
 +
                                                        <td>L0 backbone (plasmid with RFP insert)  </td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PETase</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984011">BBa_K2984011 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PETase CDS </td>
 +
                                                        <td>B3-B4</td>
 +
                                                        <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Hyg</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984012">BBa_K2984012 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS </td>
 +
                                                        <td>B3-B4</td>
 +
                                                        <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ptxD</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984013">BBa_K2984013 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS </td>
 +
                                                        <td>B3-B4</td>
 +
                                                        <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-6xHis tag</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984014">BBa_K2984014</a> </td>
 +
                                                        <td>Tag</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 6x histidine tag</td>
 +
                                                        <td>B5-B5</td>
 +
                                                        <td style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td><!hellblau>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-3xHis tag</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984015">BBa_K2984015</a> </td>
 +
                                                        <td>Tag</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 3x histidine tag</td>
 +
                                                        <td>B5-B5</td>
 +
                                                        <td style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td><!hellblau>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-SP<sub>20</sub> </td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984016">BBa_K2984016</a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement</td>
 +
                                                        <td>B5-B5</td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-YFP</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984017">BBa_K2984017 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
 +
                                                        <td>B3-B4</td>
 +
                                                        <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-RbcS2</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984018">BBa_K2984018</a> </td>
 +
                                                        <td>Terminator</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with RuBisCo terminator </td>
 +
                                                        <td>B5-C1</td>
 +
                                                        <td style="color:#0A2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-YFP</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984020">BBa_K2984020 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
 +
                                                        <td>B5-B5</td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-RbcS2</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984021">BBa_K2984021</a> </td>
 +
                                                        <td>Terminator</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with RuBisCo terminator </td>
 +
                                                        <td>B6-C1</td>
 +
                                                        <td style="color:#0A2187;text-align:center">&#9607;</td><!dunkelblau>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PsaD</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984022">BBa_K2984022 </a> </td>
 +
                                                        <td>Regulatory </td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PsaD promoter  </td>
 +
                                                        <td>A1-A3</td>
 +
                                                        <td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td><!grün>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-YFP</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984024">BBa_K2984024 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS </td>
 +
                                                        <td>B4-B4</td>
 +
                                                        <td style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td><!hbl>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-AR</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984025">BBa_K2984025 </a> </td>
 +
                                                        <td>Regulatory </td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with AR promoter  </td>
 +
                                                        <td>A1-B1</td>
 +
                                                        <td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td><!grün>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ptxD</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K29840026">BBa_K2984026 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS </td>
 +
                                                        <td>B3-B3</td>
 +
                                                        <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                   
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Linker</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984034">BBa_K2984034</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Linker sequence </td>
 +
                                                        <td>B2-B2</td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Ble</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984040">BBa_K2984040</a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Bleomycin resistance </td>
 +
                                                        <td>B1-B1</td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-scp</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984044">BBa_K2984044</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with self-cleaving resistance </td>
 +
                                                        <td>B1-B1</td>
 +
                                                        <td>-</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                       
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PsaDIntron</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984046">BBa_K2984046</a> </td>
 +
                                                        <td>Regulatory</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PsaDIntron</td>
 +
                                                        <td> A1-A3</td>
 +
                                                        <td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td><!grün>
 +
                                                    </tr>                                             
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PETase</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984049">BBa_K2984049</a> </td>
 +
                                                        <td>Regulatory</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PETase</td>
 +
                                                        <td>B3-B3</td>
 +
                                                        <td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td><!rot>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                 
 +
 
 +
                                                   
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-amp</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984058">BBa_K2984058</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>Linker L1c -> L0</td>
 +
                                                        <td> - </td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0 Linker</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984060">BBa_K2984060</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>Linker L0 -> L1a</td>
 +
                                                        <td> - </td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0 Linker</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984061">BBa_K2984061</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>Linker L0 -> L1b</td>
 +
                                                        <td> - </td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L2 Linker</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984062">BBa_K2984062</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>Linker L2 -> L1b</td>
 +
                                                        <td> - </td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                   
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>Linker sequence</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984034">BBa_K2984034</a> </td>
 +
                                                        <td>Intermediate</td>
 +
                                                        <td>Linker sequence</td>
 +
                                                        <td> B2-B2 </td>
 +
                                                        <td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td><!grau>
 +
                                                    </tr>
 +
 
 +
                                                </table>
 +
 
 +
</div>
 +
 
 +
</br>
 +
             
 +
<!------------------------------------------ TWO COLUMN IMG LEFT -------------------------------------------------->
 +
<div class="width-limit padding-container" >
 +
</br></br>
 +
                    <h3  class="headline3">Here's how our color-code works</h3>
 +
               
 +
</br>
 +
                           
 
</div>
 
</div>
 +
<div class="two-columns no-margin-top">
 +
                          </br>
 +
<div>
 +
                        <p>
 +
                          <table>
 +
  <tr>
 +
<th scope="col">Promoter</th>
 +
<th scope="col">5' UTR</th>
 +
<th scope="col">CDS</th>
 +
<th scope="col">CDS/Tag</th>
 +
<th scope="col">Terminator</th>
 +
<th scope="col">Linker</th>
 +
                                                    </tr>
 +
<tr>
 +
<td style="text-align:center">A1/A3</br>A1/B1</td>
 +
<td style="text-align:center">B1/B2</td>
 +
<td style="text-align:center">B3/B4</br>B3/B3</td>
 +
<td style="text-align:center">B4/B4</td>
 +
<td style="text-align:center">B5/C1</br>(B6/C1)</td>
 +
<td style="text-align:center">-</td>
 +
</tr>
 +
<tr>
 +
<td style="color:#1AA67A;text-align:center">&#9607;</td>
 +
<td style="color:#FFD185;text-align:center">&#9607;</td>
 +
<td style="color:#FC4A1F;text-align:center">&#9607;</td>
 +
<td style="color:#A6C2ED;text-align:center">&#9607;</td>
 +
<td style="color:#0A2187;text-align:center">&#9607;</td>
 +
<td style="color:#E4DEE7;text-align:center">&#9607;</td>
 +
</tr>
 +
</table>
 +
                        </p></div>
 +
<div>
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/6/69/T--Humboldt_Berlin--color-code_parts.png" alt="Our color-code for L0 parts" />
 +
                    </div>
 
</div>
 
</div>
 +
<!--------------------------------------- TWO COLUMN IMG LEFT END ----------------------------------------------->
  
  
−
<div class="column full_size">
+
<!-------------------------------------- GHOST PARTS ------------------------------------------------------------>
−
<h3>Best Basic Part Special Prize</h3>
+
  
−
<p> To be eligible for this award, this part <b>must be well documented on the part's Main Page on the Registry</b>. If you have a part you wish to nominate your team for this <a href="https://2019.igem.org/Judging/Awards">special prize</a>, make sure you add your part number to your <a href="https://2019.igem.org/Judging/Judging_Form">judging form</a> and delete the alert box at the top of this page.
+
<div class="width-limit padding-container"style="width: 60%; margin-left:auto;margin-right:auto">
 +
<img src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/0/06/T--Humboldt_Berlin--warning_not-moclo.png" style="max-width:50%; margin-left: auto; margin-right: auto;"/>
 +
</div>  
  
 
<br><br>
 
<br><br>
−
<b>Please note:</b> Judges will only look at the first part number you list, so please only enter ONE (1) part number in the judging form for this prize. </p>
+
<div class="width-limit padding-container ptable" style="width: 60%; margin-left:auto;margin-right:auto">
−
</div>
+
<h3 class="headline3">Our ghost (not moclo compatible) parts &#x1f47b;</h3>
 +
<table>
  
  
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <th scope="col">Part Name</th>
 +
                                                        <th scope="col">Registry Name </th>
 +
                                                        <th scope="col">Registry Type</th>
 +
                                                        <th scope="col">Description </th>
 +
                                                    </tr>
 +
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ARS1</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984066">BBa_K2984066 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 3'UTR Arylsulfatase1 secretion signal</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-GLE</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984067">BBa_K2984067 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 3'UTR gametolysin secretion signal</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-AR</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984068">BBa_K2984068 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with AR promoter</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PETase</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984069">BBa_K2984069 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PETase</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Hyg</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984070">BBa_K2984070 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ptxD</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984071">BBa_K2984071 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-6xHistag</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984072">BBa_K2984072 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with 6x histidine tag</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-3xHis tag</td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984073">BBa_K2984073 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td> L0 backbone with 3x histidine tag</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-SP<sub>20</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984074">BBa_K2984074 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td> L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-YFP</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984075">BBa_K2984075 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td> L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-RbcS2</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984076">BBa_K2984076 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with RuBisCo terminator</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PsaD</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984077">BBa_K2984077 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PsaD promoter</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-PsaDIntron</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984078">BBa_K2984078 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with PsaDIntron</td>
 +
                                                    </tr>
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-Cah</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984079">BBa_K2984079 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Carboanhyydrase</td>
 +
                                                    </tr>
 +
 +
                                                    <tr>
 +
                                                        <td>L0-ble+scp</sub></td>
 +
                                                        <td> <a href="http://parts.igem.org/wiki/index.php?title=Part:BBa_K2984090">BBa_K2984090 </a> </td>
 +
                                                        <td>Coding</td>
 +
                                                        <td>L0 backbone with Bleomycin resistance</td>
 +
                                                    </tr>
 +
</table>
 +
</div>
 +
<!--------------------------------------- GHOST PART END -----------------------------------------------> 
 +
 +
           
 +
<!--------------------------------------- TO TOP LINK ----------------------------------------------->
 +
                <a href="#" class="to-top-link">
 +
                    <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/3/3e/T--Humboldt_Berlin--ArrowDown.jpg" /> Go to top
 +
                </a>
 +
                <!--------------------------------------- TO TOP LINK END ------------------------------------------->
 +
</section>
 +
    <!------------------------------------------ FOOTER ---------------------------------------->
 +
    <div class="footer-container">
 +
        <footer class="width-limit">
 +
            <img src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/e/ee/T--Humboldt_Berlin--logo_black.png" class="footer-logo" alt="Chlamylicious Logo Black" />
 +
            <div class="footer-right">
 +
                <ul>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="/Team:Humboldt_Berlin">
 +
                            Home
 +
                        </a>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Team">
 +
                            Team
 +
                        </a>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Description">
 +
                            Project
 +
                        </a>
 +
                    </li>
 +
                </ul>
 +
                <ul>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Parts">
 +
                            Parts
 +
                        </a>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Safety">
 +
                            Safety
 +
                        </a>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="/Team:Humboldt_Berlin/Human_Practices">
 +
                            Human Practices
 +
                        </a>
 +
                    </li>
 +
                    <li>
 +
                        <a href="https://igem.org/2019_Judging_Form?team=Humboldt_Berlin">
 +
                            For Judges
 +
                        </a>
 +
                    </li>
 +
                </ul>
 +
            </div>
 +
        </footer>
 +
    </div>
  
 +
    <!------------------------------------------ FOOTER END ---------------------------------------->
  
 +
    <script>
 +
        (function () {
 +
              document.querySelector('.no-js').classList.add('js')
 +
              document.querySelector('.no-js').classList.remove('no-js')
 +
            }())
 +
           
 +
            window.addEventListener("scroll", function () {
 +
              const elements = document.querySelectorAll('.is-revealing');
 +
           
 +
              [].forEach.call(elements, function(el) {
 +
                if (isElementVisible(el)) {
 +
                  el.classList.add('is-revealing-visible')
 +
                }
 +
              });
 +
            });
 +
           
 +
            function isElementVisible(el) {
 +
              var top = el.offsetTop;
 +
              var height = el.offsetHeight;
 +
           
 +
              while(el.offsetParent) {
 +
                el = el.offsetParent;
 +
                top += el.offsetTop;
 +
              }
 +
           
 +
              return (
 +
                (top + height) <= (window.pageYOffset + window.innerHeight) + 100
 +
              );
 +
            }
 +
           
 +
                    var readMores = document.querySelectorAll('.expandable-readall');
 +
                    var allContainers = document.querySelectorAll('.expandable-container');
 +
           
 +
                    for (var i = 0; i < readMores.length; i++) {
 +
                        readMores[i].addEventListener('click', function(event) {
 +
                            var container = this.closest('.expandable-container');
 +
                            if (container.classList.contains('open')) {
 +
                                container.classList.remove('open');
 +
                            } else {
 +
                                container.classList.add('open');
 +
                            }
 +
                        });
 +
                    }
 +
           
 +
                    document.querySelector('.collapse-all').addEventListener('click', function() {
 +
                        for (var i = 0; i < allContainers.length; i++) {
 +
                            allContainers[i].classList.remove('open');
 +
                        };
 +
                    });
 +
           
 +
                    document.querySelector('.expand-all').addEventListener('click', function() {
 +
                        for (var i = 0; i < allContainers.length; i++) {
 +
                            allContainers[i].classList.add('open');
 +
                        };
 +
                    });
 +
    </script>
  
 
</html>
 
</html>

Latest revision as of 14:00, 21 October 2019

Building Blocks

Basic Parts

Part Name Registry Name Registry Type Description Fusion Sites Position in L1
L0-ARS1 BBa_K2984000 Coding L0 backbone with 3'UTR Arylsulfatase1 secretion signal B2-B2 -
L0-GLE BBa_K2984001 Coding L0 backbone with 3'UTR gametolysin secretion signal B2-B2 -
L0-RFP BBa_K2984004 Coding L0 backbone with RFP - -
L0-Paro BBa_K2984006 Coding L0 backbone with Paromomycine resistance CDS B3-B4 -
L0-amp BBa_K2984007 Coding L0 backbone with ampilicin resistance - -
L0-PsaD BBa_K2984008 Regulatory L0 backbone with PsaD promoter A1-B1 ▇
L0-AR BBa_K2984009 Regulatory L0 backbone with AR promoter A1-A3 ▇
L0 - Backbone BBa_K2984010 Plasmid L0 backbone (plasmid with RFP insert) - -
L0-PETase BBa_K2984011 Coding L0 backbone with PETase CDS B3-B4 ▇
L0-Hyg BBa_K2984012 Coding L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS B3-B4 ▇
L0-ptxD BBa_K2984013 Coding L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS B3-B4 ▇
L0-6xHis tag BBa_K2984014 Tag L0 backbone with 6x histidine tag B5-B5 ▇
L0-3xHis tag BBa_K2984015 Tag L0 backbone with 3x histidine tag B5-B5 ▇
L0-SP20 BBa_K2984016 Coding L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement B5-B5 -
L0-YFP BBa_K2984017 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B3-B4 ▇
L0-RbcS2 BBa_K2984018 Terminator L0 backbone with RuBisCo terminator B5-C1 ▇
L0-YFP BBa_K2984020 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B5-B5 -
L0-RbcS2 BBa_K2984021 Terminator L0 backbone with RuBisCo terminator B6-C1 ▇
L0-PsaD BBa_K2984022 Regulatory L0 backbone with PsaD promoter A1-A3 ▇
L0-YFP BBa_K2984024 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS B4-B4 ▇
L0-AR BBa_K2984025 Regulatory L0 backbone with AR promoter A1-B1 ▇
L0-ptxD BBa_K2984026 Coding L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS B3-B3 ▇
L0-Linker BBa_K2984034 Intermediate L0 backbone with Linker sequence B2-B2 ▇
L0-Ble BBa_K2984040 Coding L0 backbone with Bleomycin resistance B1-B1 -
L0-scp BBa_K2984044 Intermediate L0 backbone with self-cleaving resistance B1-B1 -
L0-PsaDIntron BBa_K2984046 Regulatory L0 backbone with PsaDIntron A1-A3 ▇
L0-PETase BBa_K2984049 Regulatory L0 backbone with PETase B3-B3 ▇
L0-amp BBa_K2984058 Intermediate Linker L1c -> L0 - ▇
L0 Linker BBa_K2984060 Intermediate Linker L0 -> L1a - ▇
L0 Linker BBa_K2984061 Intermediate Linker L0 -> L1b - ▇
L2 Linker BBa_K2984062 Intermediate Linker L2 -> L1b - ▇
Linker sequence BBa_K2984034 Intermediate Linker sequence B2-B2 ▇



Here's how our color-code works



Promoter 5' UTR CDS CDS/Tag Terminator Linker
A1/A3
A1/B1		 B1/B2 B3/B4
B3/B3		 B4/B4 B5/C1
(B6/C1)		 -
▇ ▇ ▇ ▇ ▇ ▇

Our color-code for L0 parts


Our ghost (not moclo compatible) parts 👻

Part Name Registry Name Registry Type Description
L0-ARS1 BBa_K2984066 Coding L0 backbone with 3'UTR Arylsulfatase1 secretion signal
L0-GLE BBa_K2984067 Coding L0 backbone with 3'UTR gametolysin secretion signal
L0-AR BBa_K2984068 Coding L0 backbone with AR promoter
L0-PETase BBa_K2984069 Coding L0 backbone with PETase
L0-Hyg BBa_K2984070 Coding L0 backbone with Hygromycin B resistance CDS
L0-ptxD BBa_K2984071 Coding L0 backbone with phosphite oxidoreductase CDS
L0-6xHistag BBa_K2984072 Coding L0 backbone with 6x histidine tag
L0-3xHis tag BBa_K2984073 Coding L0 backbone with 3x histidine tag
L0-SP20 BBa_K2984074 Coding L0 backbone with glycomodule for secretion enhancement
L0-YFP BBa_K2984075 Coding L0 backbone with yellow fluorescent protein CDS
L0-RbcS2 BBa_K2984076 Coding L0 backbone with RuBisCo terminator
L0-PsaD BBa_K2984077 Coding L0 backbone with PsaD promoter
L0-PsaDIntron BBa_K2984078 Coding L0 backbone with PsaDIntron
L0-Cah BBa_K2984079 Coding L0 backbone with Carboanhyydrase
L0-ble+scp BBa_K2984090 Coding L0 backbone with Bleomycin resistance
Go to top