Line 23: | Line 23: | ||
<button id="button_1" onclick="window.location.href='#popup2'" class="ownbutton" type = "submit" alt="Hear what we did for dyslexic people" value = "myimage"> | <button id="button_1" onclick="window.location.href='#popup2'" class="ownbutton" type = "submit" alt="Hear what we did for dyslexic people" value = "myimage"> | ||
− | <img class="buttonimagefront" src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/0/07/T--DTU-Denmark--dyslexia.svg" /> | + | <!--<img class="buttonimagefront" src="https://static.igem.org/mediawiki/2019/0/07/T--DTU-Denmark--dyslexia.svg" /> |
</button> | </button> | ||
Line 38: | Line 38: | ||
</div> | </div> | ||
</div> | </div> | ||
− | </div> | + | </div>--> |
<div class="mm-dropdown"> | <div class="mm-dropdown"> | ||
Line 583: | Line 583: | ||
]; | ]; | ||
+ | |||
+ | |||
Line 615: | Line 617: | ||
desc_p5 = "The Technical University of Denmark harbors unique facilities and personnel with great expertise in working with synthetic biology in filamentous fungi. The department furthermore has a fermentation core which allows fungi to be examined in multiple scales and under differing conditions as well as control of the pH and monitoring of CO2-production during growth."; | desc_p5 = "The Technical University of Denmark harbors unique facilities and personnel with great expertise in working with synthetic biology in filamentous fungi. The department furthermore has a fermentation core which allows fungi to be examined in multiple scales and under differing conditions as well as control of the pH and monitoring of CO2-production during growth."; | ||
− | desc_p6 = "Promoters are essential in the production of metabolites, as they allow for the up or down regulation of gene expression. The lack of fungal parts as well as the resources of the department inspired this year’s team to produce a library of synthetic promoters for filamentous fungi and other eukaryotic organisms. We built a piece of software which compared the genomes of several different species of Aspergillus to determine sequence conservation and create a library of synthetic promoters. The library provides promoters of different strengths that give consistent results between batches and scales."; | + | desc_p6 = "Promoters are essential in the production of metabolites, as they allow for the up or down regulation of gene expression. The lack of fungal parts as well as the resources of the department inspired this year’s team to produce a library of synthetic promoters for filamentous fungi and other eukaryotic organisms. We built a piece of software which compared the genomes of several different species of <i>Aspergillus</i> to determine sequence conservation and create a library of synthetic promoters. The library provides promoters of different strengths that give consistent results between batches and scales."; |
− | desc_p7 ="Following discussions with several scientists and companies the team decided on a strategy that would supply future iGEM teams with the tools required to do synthetic biology in Aspergillus as well as close a gap in scientific literature, making our project useful in iGEM, academia, and industry."; | + | desc_p7 ="Following discussions with several scientists and companies the team decided on a strategy that would supply future iGEM teams with the tools required to do synthetic biology in <i>Aspergillus</i> as well as close a gap in scientific literature, making our project useful in iGEM, academia, and industry."; |
//Front page major text | //Front page major text | ||
Line 631: | Line 633: | ||
//alt text for the blind: | //alt text for the blind: | ||
− | leap = "Library of Engineered Aspergillus Promoters"; | + | leap = "Library of Engineered <i>Aspergillus</i> Promoters"; |
video_1 ="The video shows a promoter being inserted into a plasmid, which is then inserted into a fungus. The fungus can then produce various ingredients for household projects."; | video_1 ="The video shows a promoter being inserted into a plasmid, which is then inserted into a fungus. The fungus can then produce various ingredients for household projects."; | ||
Line 658: | Line 660: | ||
fact_4="Half of the industrially manufactured enzymes are produced by filamentous fungi."; | fact_4="Half of the industrially manufactured enzymes are produced by filamentous fungi."; | ||
− | fact_5="Aspergillus spp. are responsible for the production of >30% of all industrially produced enzymes."; | + | fact_5="<i>Aspergillus</i> spp. are responsible for the production of >30% of all industrially produced enzymes."; |
fact_6="The total annual revenue from enzymes produced by <i>Aspergillus</i> spp. is 480 mio USD per year [3]."; | fact_6="The total annual revenue from enzymes produced by <i>Aspergillus</i> spp. is 480 mio USD per year [3]."; | ||
Line 729: | Line 731: | ||
desc_p5 = "Το Πολυτεχνείο της Δανίας διαθέτει μοναδικές εγκαταστάσεις και έμπειρο προσωπικό στον τομέα της συνθετικής βιολογίας των νηματοειδών μυκήτων. Επιπλέον, υπάρχουν εγκαταστάσεις ζύμωσης που επιτρέπουν την διερεύνηση των μυκήτων σε πολλαπλές κλίμακες και υπό διαφορετικές συνθήκες, καθώς και τον έλεγχο του pH και την παρακολούθηση των εκπομπών CO2 κατά της διάρκεια της ανάπτυξης."; | desc_p5 = "Το Πολυτεχνείο της Δανίας διαθέτει μοναδικές εγκαταστάσεις και έμπειρο προσωπικό στον τομέα της συνθετικής βιολογίας των νηματοειδών μυκήτων. Επιπλέον, υπάρχουν εγκαταστάσεις ζύμωσης που επιτρέπουν την διερεύνηση των μυκήτων σε πολλαπλές κλίμακες και υπό διαφορετικές συνθήκες, καθώς και τον έλεγχο του pH και την παρακολούθηση των εκπομπών CO2 κατά της διάρκεια της ανάπτυξης."; | ||
− | desc_p6 ="Οι υποκινητές είναι απαραίτητοι στην παραγωγή μεταβολιτών, καθώς επιτρέπουν τη ρύθμιση είτε προς τα πάνω είτε προς τα κάτω της γονιδιακής έκφρασης. Η έλλειψη γενετικών τμημάτων στο αρχείο του iGEM σε συνδυασμό με τους πόρους του τμήματος ενέπνευσε την φετινή ομάδα να δημιουργήσει μια βιβλιοθήκη συνθετικών υποκινητών για τους νηματοειδείς μύκητες και άλλων ευκαρυωτικών οργανισμών. Έτσι, κατασκευάσαμε ένα λογισμικό που συγκρίνει τα γονιδιώματα διαφόρων ειδών του γένους Aspergillus για να προσδιορίσει την συντήρηση των ακολουθιών και έπειτα συνθέτει την βιβλιοθήκη των υποκινητών. Η συγκεκριμένη βιβλιοθήκη προσφέρει υποκινητές με διαφορετική ισχύ που δίνουν συνεπή αποτελέσματα ανά παρτίδα και ανά κλίμακα."; | + | desc_p6 ="Οι υποκινητές είναι απαραίτητοι στην παραγωγή μεταβολιτών, καθώς επιτρέπουν τη ρύθμιση είτε προς τα πάνω είτε προς τα κάτω της γονιδιακής έκφρασης. Η έλλειψη γενετικών τμημάτων στο αρχείο του iGEM σε συνδυασμό με τους πόρους του τμήματος ενέπνευσε την φετινή ομάδα να δημιουργήσει μια βιβλιοθήκη συνθετικών υποκινητών για τους νηματοειδείς μύκητες και άλλων ευκαρυωτικών οργανισμών. Έτσι, κατασκευάσαμε ένα λογισμικό που συγκρίνει τα γονιδιώματα διαφόρων ειδών του γένους <i>Aspergillus</i> για να προσδιορίσει την συντήρηση των ακολουθιών και έπειτα συνθέτει την βιβλιοθήκη των υποκινητών. Η συγκεκριμένη βιβλιοθήκη προσφέρει υποκινητές με διαφορετική ισχύ που δίνουν συνεπή αποτελέσματα ανά παρτίδα και ανά κλίμακα."; |
− | desc_p7 ="Έπειτα από συζητήσεις με μέλη της επιστημονικής κοινότητας και της βιομηχανίας η ομάδα αποφάσισε να κινηθεί με στόχο να εφοδιάσει την μελλοντικές ομάδες του iGEM με απαραίτητα εργαλεία για τον χειρισμό του γένους Aspergillus στο πλαίσιο της συνθετικής βιολογίας καθώς και να γεμίσει ένα κενό της επιστημονικής βιβλιογραφίας, δημιουργώντας μία εργασία χρήσιμη για το iGEM, την ακαδημαϊκή κοινότητα και την βιομηχανία."; | + | desc_p7 ="Έπειτα από συζητήσεις με μέλη της επιστημονικής κοινότητας και της βιομηχανίας η ομάδα αποφάσισε να κινηθεί με στόχο να εφοδιάσει την μελλοντικές ομάδες του iGEM με απαραίτητα εργαλεία για τον χειρισμό του γένους <i>Aspergillus</i> στο πλαίσιο της συνθετικής βιολογίας καθώς και να γεμίσει ένα κενό της επιστημονικής βιβλιογραφίας, δημιουργώντας μία εργασία χρήσιμη για το iGEM, την ακαδημαϊκή κοινότητα και την βιομηχανία."; |
//Front page major text | //Front page major text | ||
Line 745: | Line 747: | ||
//alt text for the blind: | //alt text for the blind: | ||
− | leap = "Library of Engineered Aspergillus Promoters" | + | leap = "Library of Engineered <i>Aspergillus</i> Promoters" |
video_1 ="Το βίντεο δείχνει έναν υποκινητή που ενσωματώνεται σε ένα πλασμίδιο, το οποίο έπειτα εισάγεται σε έναν μύκητα. Με αυτόν τον τρόπο ο μύκητας μπορεί να παράγει διάφορα συστατικά προϊόντων οικιακής χρήσης."; | video_1 ="Το βίντεο δείχνει έναν υποκινητή που ενσωματώνεται σε ένα πλασμίδιο, το οποίο έπειτα εισάγεται σε έναν μύκητα. Με αυτόν τον τρόπο ο μύκητας μπορεί να παράγει διάφορα συστατικά προϊόντων οικιακής χρήσης."; | ||
Line 767: | Line 769: | ||
fact_2 ="Υπάρχουν περίπου 5,1 εκατομμύρια διαφορετικά είδη νηματοειδών μυκήτων."; | fact_2 ="Υπάρχουν περίπου 5,1 εκατομμύρια διαφορετικά είδη νηματοειδών μυκήτων."; | ||
− | fact_3 ="Το είδος Aspergillus niger χρησιμοποιείται για την παραγωγή >99% του συνολικού κιτρικού οξέος που διατίθεται στην αγορά."; | + | fact_3 ="Το είδος <i>Aspergillus</i> niger χρησιμοποιείται για την παραγωγή >99% του συνολικού κιτρικού οξέος που διατίθεται στην αγορά."; |
fact_4 ="Το ήμισυ των βιομηχανικά παραγόμενων ενζύμων προέρχεται από τη χρήση νηματοειδών μυκήτων."; | fact_4 ="Το ήμισυ των βιομηχανικά παραγόμενων ενζύμων προέρχεται από τη χρήση νηματοειδών μυκήτων."; | ||
− | fact_5 ="Το γένος Aspergillus είναι υπεύθυνο για την παραγωγή >30% του συνόλου των βιομηχανικά παραγόμενων ενζύμων."; | + | fact_5 ="Το γένος <i>Aspergillus</i> είναι υπεύθυνο για την παραγωγή >30% του συνόλου των βιομηχανικά παραγόμενων ενζύμων."; |
− | fact_6 ="Τα συνολικά ετήσια έσοδα από ένζυμα που παράγονται από το γένος Aspergillus αγγίζουν τα 480 εκατομμύρια δολάρια ανά έτος [3]."; | + | fact_6 ="Τα συνολικά ετήσια έσοδα από ένζυμα που παράγονται από το γένος <i>Aspergillus</i> αγγίζουν τα 480 εκατομμύρια δολάρια ανά έτος [3]."; |
fact_7 ="Στο αρχείο του iGEM, λιγότερο από το 5% των καταχωρημένων υποκινητών προέρχεται από νηματοειδείς μύκητες."; | fact_7 ="Στο αρχείο του iGEM, λιγότερο από το 5% των καταχωρημένων υποκινητών προέρχεται από νηματοειδείς μύκητες."; | ||
Line 832: | Line 834: | ||
desc_p5 ="La Universidad Técnica de Dinamarca alberga instalaciones únicas y personal con gran experiencia en el trabajo con biología sintética en hongos filamentosos. Además, el departamento tiene un núcleo de fermentación que permite examinar los hongos en múltiples escalas y bajo diferentes condiciones, así como el control del pH y el monitoreo de la producción de CO2 durante el crecimiento."; | desc_p5 ="La Universidad Técnica de Dinamarca alberga instalaciones únicas y personal con gran experiencia en el trabajo con biología sintética en hongos filamentosos. Además, el departamento tiene un núcleo de fermentación que permite examinar los hongos en múltiples escalas y bajo diferentes condiciones, así como el control del pH y el monitoreo de la producción de CO2 durante el crecimiento."; | ||
− | desc_p6 ="Los promotores son esenciales en la producción de metabolitos, ya que permiten la regulación hacia arriba o hacia abajo de la expresión génica. La falta de partes fúngicas, así como los recursos del departamento, inspiraron al equipo de este año a producir una biblioteca de promotores sintéticos para hongos filamentosos y otros organismos eucariotas. Por eso, construimos un software que comparó los genomas de varias especies diferentes de Aspergillus para determinar la conservación de las secuencias y crear una biblioteca de promotores sintéticos. La biblioteca proporciona promotores de diferentes potencias que dan resultados consistentes entre lotes y escalas."; | + | desc_p6 ="Los promotores son esenciales en la producción de metabolitos, ya que permiten la regulación hacia arriba o hacia abajo de la expresión génica. La falta de partes fúngicas, así como los recursos del departamento, inspiraron al equipo de este año a producir una biblioteca de promotores sintéticos para hongos filamentosos y otros organismos eucariotas. Por eso, construimos un software que comparó los genomas de varias especies diferentes de <i>Aspergillus</i> para determinar la conservación de las secuencias y crear una biblioteca de promotores sintéticos. La biblioteca proporciona promotores de diferentes potencias que dan resultados consistentes entre lotes y escalas."; |
− | desc_p7 ="Luego de discusiones con varios científicos y compañías, el equipo decidió una estrategia que proporcionaría a los futuros equipos de iGEM las herramientas necesarias para hacer biología sintética en Aspergillus, así como cerrar una brecha en la literatura científica, haciendo que nuestro proyecto sea útil en iGEM, la academia y la industria."; | + | desc_p7 ="Luego de discusiones con varios científicos y compañías, el equipo decidió una estrategia que proporcionaría a los futuros equipos de iGEM las herramientas necesarias para hacer biología sintética en <i>Aspergillus</i>, así como cerrar una brecha en la literatura científica, haciendo que nuestro proyecto sea útil en iGEM, la academia y la industria."; |
//Front page major text | //Front page major text | ||
Line 849: | Line 851: | ||
//alt text for the blind: | //alt text for the blind: | ||
− | leap = "Library of Engineered Aspergillus Promoters"; | + | leap = "Library of Engineered <i>Aspergillus</i> Promoters"; |
video_1 ="El video muestra un promotor insertado en un plásmido, que luego se inserta en un hongo. El hongo puede producir varios ingredientes para artículos domésticos."; | video_1 ="El video muestra un promotor insertado en un plásmido, que luego se inserta en un hongo. El hongo puede producir varios ingredientes para artículos domésticos."; | ||
Line 871: | Line 873: | ||
fact_2 ="Hay aproximadamente 5,1 millones de especies diferentes de hongos filamentosos."; | fact_2 ="Hay aproximadamente 5,1 millones de especies diferentes de hongos filamentosos."; | ||
− | fact_3 ="Aspergillus niger produce >99% de todo el ácido cítrico vendido."; | + | fact_3 ="<i>Aspergillus niger</i> produce >99% de todo el ácido cítrico vendido."; |
fact_4 ="La mitad de las enzimas fabricadas industrialmente son producidas por hongos filamentosos."; | fact_4 ="La mitad de las enzimas fabricadas industrialmente son producidas por hongos filamentosos."; | ||
− | fact_5 ="Aspergillus spp. son responsables de la producción de >30% de todas las enzimas producidas industrialmente."; | + | fact_5 ="<i>Aspergillus</i> spp. son responsables de la producción de >30% de todas las enzimas producidas industrialmente."; |
− | fact_6 ="Los ingresos anuales totales de las enzimas producidas por Aspergillus spp. es de 480 millones de USD por año [3]."; | + | fact_6 ="Los ingresos anuales totales de las enzimas producidas por <i>Aspergillus</i> spp. es de 480 millones de USD por año [3]."; |
fact_7 ="En el registro de iGEM, menos del 5% de los promotores registrados son de hongos filamentosos."; | fact_7 ="En el registro de iGEM, menos del 5% de los promotores registrados son de hongos filamentosos."; | ||
Line 936: | Line 938: | ||
desc_5 ="L'Université Technique du Danemark abrite des installations uniques et un personnel doté d'une grande expertise dans le domaine de la biologie synthétique des champignons filamenteux. Le département dispose des installations de fermentation qui permettent d'examiner les champignons à différents niveaux et dans différentes conditions, ainsi que de contrôler le pH et de surveiller la production de CO2 pendant la croissance."; | desc_5 ="L'Université Technique du Danemark abrite des installations uniques et un personnel doté d'une grande expertise dans le domaine de la biologie synthétique des champignons filamenteux. Le département dispose des installations de fermentation qui permettent d'examiner les champignons à différents niveaux et dans différentes conditions, ainsi que de contrôler le pH et de surveiller la production de CO2 pendant la croissance."; | ||
− | desc_p6 ="Les promoteurs sont essentiels pour la production de métabolites, car ils permettent la régulation de l'expression des gènes. L’absence de composants fongiques et les ressources du département ont incité l’équipe de cette année à créer une bibliothèque de promoteurs synthétiques pour les champignons filamenteux et autres organismes eucaryotes. Donc, nous avons créé un logiciel pour comparer les génomes de plusieurs espèces | + | desc_p6 ="Les promoteurs sont essentiels pour la production de métabolites, car ils permettent la régulation de l'expression des gènes. L’absence de composants fongiques et les ressources du département ont incité l’équipe de cette année à créer une bibliothèque de promoteurs synthétiques pour les champignons filamenteux et autres organismes eucaryotes. Donc, nous avons créé un logiciel pour comparer les génomes de plusieurs espèces d’<i>Aspergillus</i> afin de déterminer la conservation des séquences et de créer une bibliothèque de promoteurs synthétiques. La bibliothèque fournit des promoteurs de différentes forces qui donnent des résultats cohérents entre les lots et les niveaux."; |
− | desc_p7 ="Après des discussions avec plusieurs scientifiques et entreprises, l'équipe a décidé d'une stratégie qui fournirait aux futures équipes d'iGEM les outils nécessaires pour faire de la biologie synthétique à Aspergillus, ainsi que de combler une lacune dans la littérature scientifique, ce qui rendrait notre projet utile pour iGEM, le monde universitaire et l'industrie."; | + | desc_p7 ="Après des discussions avec plusieurs scientifiques et entreprises, l'équipe a décidé d'une stratégie qui fournirait aux futures équipes d'iGEM les outils nécessaires pour faire de la biologie synthétique à <i>Aspergillus</i>, ainsi que de combler une lacune dans la littérature scientifique, ce qui rendrait notre projet utile pour iGEM, le monde universitaire et l'industrie."; |
//Front page major text | //Front page major text | ||
Line 953: | Line 955: | ||
//alt text for the blind: | //alt text for the blind: | ||
− | leap = "Library of Engineered Aspergillus Promoters"; | + | leap = "Library of Engineered <i>Aspergillus</i> Promoters"; |
video_1 ="La vidéo montre un promoteur inséré dans un plasmide, qui est ensuite inséré dans un champignon. Le champignon peut alors produire divers ingrédients pour des produits ménagers."; | video_1 ="La vidéo montre un promoteur inséré dans un plasmide, qui est ensuite inséré dans un champignon. Le champignon peut alors produire divers ingrédients pour des produits ménagers."; | ||
Line 975: | Line 977: | ||
fact_2 ="Il existe environ 5,1 millions d'espèces différentes de champignons filamenteux."; | fact_2 ="Il existe environ 5,1 millions d'espèces différentes de champignons filamenteux."; | ||
− | fact_3 ="Aspergillus niger produit > 99% de tout l'acide citrique vendu."; | + | fact_3 ="<i>Aspergillus niger</i> produit > 99% de tout l'acide citrique vendu."; |
fact_4 ="La moitié des enzymes de fabrication industrielle sont produites par des champignons filamenteux."; | fact_4 ="La moitié des enzymes de fabrication industrielle sont produites par des champignons filamenteux."; | ||
− | fact_5 ="Aspergillus spp. sont responsables de la production de >30% de toutes les enzymes produites industriellement."; | + | fact_5 ="<i>Aspergillus</i> spp. sont responsables de la production de >30% de toutes les enzymes produites industriellement."; |
− | fact_6 ="Le revenu annuel total des enzymes produites par Aspergillus spp. est de 480 millions USD par an [3]."; | + | fact_6 ="Le revenu annuel total des enzymes produites par <i>Aspergillus</i> spp. est de 480 millions USD par an [3]."; |
fact_7 ="Dans le registre iGEM, moins de 5% des promoteurs enregistrés sont issus de champignons filamenteux."; | fact_7 ="Dans le registre iGEM, moins de 5% des promoteurs enregistrés sont issus de champignons filamenteux."; | ||
Line 1,043: | Line 1,045: | ||
desc_p6 ="Promotere er essentielle for produktionen af metabolitter, da de tillader op- eller nedregulering af genekspression. Manglen på svampedele samt afdelingens ressourcer inspirerede dette års hold til at producere et bibliotek af syntetiske promotere til filamentiøse svampe og andre eukaryote organismer. Vi udviklede et stykke software, der sammenligner genomerne på flere forskellige arter af <i>Aspergillus</i> for at finde konsensussekvenser og skabe et bibliotek af syntetiske promotere. Biblioteket tilbyder promotere af forskellig styrke, som giver konsekvente resultater mellem batcher og skalaer."; | desc_p6 ="Promotere er essentielle for produktionen af metabolitter, da de tillader op- eller nedregulering af genekspression. Manglen på svampedele samt afdelingens ressourcer inspirerede dette års hold til at producere et bibliotek af syntetiske promotere til filamentiøse svampe og andre eukaryote organismer. Vi udviklede et stykke software, der sammenligner genomerne på flere forskellige arter af <i>Aspergillus</i> for at finde konsensussekvenser og skabe et bibliotek af syntetiske promotere. Biblioteket tilbyder promotere af forskellig styrke, som giver konsekvente resultater mellem batcher og skalaer."; | ||
− | desc_p7 ="Som følge af samtaler med flere forskere og firmaer, besluttede holdet sig for en strategi, der ville forsyne fremtidige iGEM-hold med værktøjerne, der kræves for at lave syntetisk biologi i Aspergillus samt at udfylde en mangel i den videnskabelige litteratur, ved at gøre vores projekt brugbart i iGEM, forskning og industrien."; | + | desc_p7 ="Som følge af samtaler med flere forskere og firmaer, besluttede holdet sig for en strategi, der ville forsyne fremtidige iGEM-hold med værktøjerne, der kræves for at lave syntetisk biologi i <i>Aspergillus</i> samt at udfylde en mangel i den videnskabelige litteratur, ved at gøre vores projekt brugbart i iGEM, forskning og industrien."; |
//Front page major text | //Front page major text | ||
Line 1,058: | Line 1,060: | ||
//alt text for the blind: | //alt text for the blind: | ||
− | leap ="Library of Engineered Aspergillus Promoters"; | + | leap ="Library of Engineered <i>Aspergillus</i> Promoters"; |
video_1 ="Videoen viser en promoter, der bliver indsat i et plasmid, som bliver indsat i en svamp. Svampen kan så producere forskellige ingredienser til hverdagsprodukter."; | video_1 ="Videoen viser en promoter, der bliver indsat i et plasmid, som bliver indsat i en svamp. Svampen kan så producere forskellige ingredienser til hverdagsprodukter."; | ||
Line 1,148: | Line 1,150: | ||
desc_p6 ="Promotorer är essentiella för produktionen av metaboliter, då de tillåter upp- eller nedreglering av genexpression. Bristen på svampdelar samt avdelningens resurser inspirerade detta årets lag till att producera ett bibliotek av syntetiska promotorer till filamentösa svampar och andra eukaryota organismer.Vi utvecklade en mjukvara, som sammanliknar på flera olika arter av <i>Aspergillus</i> för at hitta konsensussekvenser och skapa ett bibliotek av syntetiska promotorer. Biblioteket erbjuder promotorer av olika styrka, som ger konsekventa resultat mellan partier och skalor."; | desc_p6 ="Promotorer är essentiella för produktionen av metaboliter, då de tillåter upp- eller nedreglering av genexpression. Bristen på svampdelar samt avdelningens resurser inspirerade detta årets lag till att producera ett bibliotek av syntetiska promotorer till filamentösa svampar och andra eukaryota organismer.Vi utvecklade en mjukvara, som sammanliknar på flera olika arter av <i>Aspergillus</i> för at hitta konsensussekvenser och skapa ett bibliotek av syntetiska promotorer. Biblioteket erbjuder promotorer av olika styrka, som ger konsekventa resultat mellan partier och skalor."; | ||
− | desc_7 ="Till följd av samtal med flera forskare och företag, valde laget en strategi, som skulle förse framtidiga iGEM-lag verktygen som krävs för att utföra syntetisk biologi i Aspergillus samt att fylla ut en brist i den vetenskapliga litteraturen, vid att göra vårt projekt brukbart i iGEM, forskning och industrin."; | + | desc_7 ="Till följd av samtal med flera forskare och företag, valde laget en strategi, som skulle förse framtidiga iGEM-lag verktygen som krävs för att utföra syntetisk biologi i <i>Aspergillus</i> samt att fylla ut en brist i den vetenskapliga litteraturen, vid att göra vårt projekt brukbart i iGEM, forskning och industrin."; |
//Front page major text | //Front page major text | ||
Line 1,163: | Line 1,165: | ||
//alt text for the blind: | //alt text for the blind: | ||
− | leap ="Library of Engineered Aspergillus Promoters"; | + | leap ="Library of Engineered <i>Aspergillus</i> Promoters"; |
video_1 ="Videon visar en promotor, som blir insatt i en plasmid, som bliver insatt i en svamp. Då kan svampen producera olika ingredienser till vardagsprodukter."; | video_1 ="Videon visar en promotor, som blir insatt i en plasmid, som bliver insatt i en svamp. Då kan svampen producera olika ingredienser till vardagsprodukter."; | ||
Line 1,254: | Line 1,256: | ||
desc_p5 ="Die Technische Universität von Dänemark (DTU), bietet alleinstehende Infrastruktur und personal, mit großer Sachkenntnis im Bereich der Arbeit mit synthetischer Biologie in Fadenpilzen. Darüber hinaus hat das Institut auch eine Fermentierungsplattform, die Untersuchungen von Pilzen in verschiedenen Größenordnungen und unter verschiedenen Verhältnissen ermöglicht. Kontrolle von CO2 werten wie auch von Ph unter dem Wachstum sind auch möglich."; | desc_p5 ="Die Technische Universität von Dänemark (DTU), bietet alleinstehende Infrastruktur und personal, mit großer Sachkenntnis im Bereich der Arbeit mit synthetischer Biologie in Fadenpilzen. Darüber hinaus hat das Institut auch eine Fermentierungsplattform, die Untersuchungen von Pilzen in verschiedenen Größenordnungen und unter verschiedenen Verhältnissen ermöglicht. Kontrolle von CO2 werten wie auch von Ph unter dem Wachstum sind auch möglich."; | ||
− | desc_p6 ="Promotoren sind für die Produktion von Metabolliten wesentlich, da sie die Regulierung der Genexpression ermöglichen. Der Mangel an Pilzteilen, wie auch das Wissen, welches sich am Institut befindet, haben das diesjährige Team inspiriert eine Bibliothek von synthetischen Promotoren für Fadenpilze und andere eukaryotische Organismen zu produzieren. Wir haben eine Software entwickelt, die die Genomen in verschiedenen Arten von Aspergillus vergleicht um das Sequenzgespräch zu ermitteln und eine Bibliothek von synthetischen Promotoren zu machen. Die Bibliothek enthält Promotoren mit verschiedenen Stärken, die konsistente Ergebnisse in verschiedenen Chargen und Maßstäben liefert."; | + | desc_p6 ="Promotoren sind für die Produktion von Metabolliten wesentlich, da sie die Regulierung der Genexpression ermöglichen. Der Mangel an Pilzteilen, wie auch das Wissen, welches sich am Institut befindet, haben das diesjährige Team inspiriert eine Bibliothek von synthetischen Promotoren für Fadenpilze und andere eukaryotische Organismen zu produzieren. Wir haben eine Software entwickelt, die die Genomen in verschiedenen Arten von <i>Aspergillus</i> vergleicht um das Sequenzgespräch zu ermitteln und eine Bibliothek von synthetischen Promotoren zu machen. Die Bibliothek enthält Promotoren mit verschiedenen Stärken, die konsistente Ergebnisse in verschiedenen Chargen und Maßstäben liefert."; |
− | desc_p7 ="Nach Gesprächen mit mehreren Forschern und Unternehmen hat das Team sich für eine Strategie entschlossen, die kommenden iGEM Teams mit den nötigen Werkzeugen ausstattet, um synthetische Biologie mit Aspergillus machen zu könne, sowie eine Lücke in der wissenschaftlichen Literatur zu füllen. Dies gibt dem Projekt sowol für iGEM, Akademische zwecke, wie auch für die Industrie einen Nutzwert."; | + | desc_p7 ="Nach Gesprächen mit mehreren Forschern und Unternehmen hat das Team sich für eine Strategie entschlossen, die kommenden iGEM Teams mit den nötigen Werkzeugen ausstattet, um synthetische Biologie mit <i>Aspergillus</i> machen zu könne, sowie eine Lücke in der wissenschaftlichen Literatur zu füllen. Dies gibt dem Projekt sowol für iGEM, Akademische zwecke, wie auch für die Industrie einen Nutzwert."; |
//Front paje major text | //Front paje major text | ||
Line 1,271: | Line 1,273: | ||
//alt text for the blind: | //alt text for the blind: | ||
− | leap ="Library of Engineered Aspergillus Promoters"; | + | leap ="Library of Engineered <i>Aspergillus</i> Promoters"; |
video_1 ="Dieses Video zeigt einen Promotor, der in einen Plasmid eingesetzt wird, welcher dann in einen Pilz eigesetzt wird. Der Pilz kann dann verschiedene Zutaten für Alltagsprodukte produzieren."; | video_1 ="Dieses Video zeigt einen Promotor, der in einen Plasmid eingesetzt wird, welcher dann in einen Pilz eigesetzt wird. Der Pilz kann dann verschiedene Zutaten für Alltagsprodukte produzieren."; | ||
Line 1,293: | Line 1,295: | ||
fact_2 ="Es gibt ca 5.1 millionen Pilzarten."; | fact_2 ="Es gibt ca 5.1 millionen Pilzarten."; | ||
− | fact_3 ="Aspergillus niger produziert >99% aller verkauften Zitronensäuren."; | + | fact_3 ="<i>Aspergillus niger</i> produziert >99% aller verkauften Zitronensäuren."; |
fact_4 ="Die hälfte aller produzierten Enzyme werden mit Fadenpilzen produziert."; | fact_4 ="Die hälfte aller produzierten Enzyme werden mit Fadenpilzen produziert."; | ||
− | fact_5 ="Aspergillus spp. is für die produktion von >30% aller industriell produzierten Enzyme verantwortlich."; | + | fact_5 ="<i>Aspergillus</i> spp. is für die produktion von >30% aller industriell produzierten Enzyme verantwortlich."; |
− | fact_6 ="Der Jährliche ertrag von Enzymen, die mit Aspergillus spp. produziert werden, ist 480 mio. USD [3]"; | + | fact_6 ="Der Jährliche ertrag von Enzymen, die mit <i>Aspergillus</i> spp. produziert werden, ist 480 mio. USD [3]"; |
fact_7 ="Im iGEM Register kommen unter 5% der registrierten Promotoren von Fadenpilzen"; | fact_7 ="Im iGEM Register kommen unter 5% der registrierten Promotoren von Fadenpilzen"; | ||
Line 1,360: | Line 1,362: | ||
desc_p5 ="L’Università Tecnica della Danimarca ospita strutture e personale unico con grande esperienza nel campo del lavoro con la biologia sintetica riguardanti i funghi filamentosi. Inoltre, il dipartimento possiede un nucleo di fermentazione che consente di esaminare i funghi su più scale e in condizioni diverse, nonché il controllo del pH e il monitoraggio della produzione di CO2 durante la crescita."; | desc_p5 ="L’Università Tecnica della Danimarca ospita strutture e personale unico con grande esperienza nel campo del lavoro con la biologia sintetica riguardanti i funghi filamentosi. Inoltre, il dipartimento possiede un nucleo di fermentazione che consente di esaminare i funghi su più scale e in condizioni diverse, nonché il controllo del pH e il monitoraggio della produzione di CO2 durante la crescita."; | ||
− | desc_p6 ="I promotori sono essenziali nella produzione di metaboliti, in quanto permettono la regolazione oscillante dell’espressione dei geni. La carenza di parti di funghi così come le risorse del dipartimento hanno ispirato il team di quest’anno a creare una libreria di promotori sintetici per i funghi filamentosi ed altri organismi eucariotici. Per creare la libreria, abbiamo costruito una parte di software che permette di paragonare i genomi di parecchie specie diverse di Aspergillus per determinare la conservazione delle sequenze e creare una libreria di promotori sintetici. La libreria fornisce promotori di diversi punti di forza che offrono risultati consistenti e riproducibili in lotti o su scale."; | + | desc_p6 ="I promotori sono essenziali nella produzione di metaboliti, in quanto permettono la regolazione oscillante dell’espressione dei geni. La carenza di parti di funghi così come le risorse del dipartimento hanno ispirato il team di quest’anno a creare una libreria di promotori sintetici per i funghi filamentosi ed altri organismi eucariotici. Per creare la libreria, abbiamo costruito una parte di software che permette di paragonare i genomi di parecchie specie diverse di <i>Aspergillus</i> per determinare la conservazione delle sequenze e creare una libreria di promotori sintetici. La libreria fornisce promotori di diversi punti di forza che offrono risultati consistenti e riproducibili in lotti o su scale."; |
− | desc_p7 ="A seguito di discussioni con diversi scienziati e compagnie, il team ha deciso una strategia che provveda ai futuri team iGEM con gli utensili necessari per fare biologia sintetica sugli Aspergillus e colmare una lacuna nella letteratura scientifica, rendendo il nostro progetto utile in iGEM, nel mondo accademico e nell’industria." | + | desc_p7 ="A seguito di discussioni con diversi scienziati e compagnie, il team ha deciso una strategia che provveda ai futuri team iGEM con gli utensili necessari per fare biologia sintetica sugli <i>Aspergillus</i> e colmare una lacuna nella letteratura scientifica, rendendo il nostro progetto utile in iGEM, nel mondo accademico e nell’industria." |
//Front page major text | //Front page major text | ||
Line 1,378: | Line 1,380: | ||
//alt text for the blind: | //alt text for the blind: | ||
− | leap = "Library of Engineered Aspergillus Promoters"; | + | leap = "Library of Engineered <i>Aspergillus</i> Promoters"; |
video_1 ="Il video mostra un promotore che viene inserito in un plasmide, che viene quindi inserito in un fungo. Il fungo può dunque produrre vari ingredienti per progetti domestici."; | video_1 ="Il video mostra un promotore che viene inserito in un plasmide, che viene quindi inserito in un fungo. Il fungo può dunque produrre vari ingredienti per progetti domestici."; | ||
Line 1,400: | Line 1,402: | ||
fact_2 ="Esistono all’incirca 5,1 milioni di diverse specie di funghi filamentosi."; | fact_2 ="Esistono all’incirca 5,1 milioni di diverse specie di funghi filamentosi."; | ||
− | fact_3 =" | + | fact_3 ="L’<i>Aspergillus niger</i> produce > 99% di tutto l’acido citrico venduto."; |
fact_4 ="La metà degli enzimi prodotti industrialmente sono prodotti da funghi filamentosi."; | fact_4 ="La metà degli enzimi prodotti industrialmente sono prodotti da funghi filamentosi."; | ||
− | fact_5 ="Aspergillus spp. Sono responsabili della produzione di > 30% di tutti gli enzimi prodotti industrialmente."; | + | fact_5 ="<i>Aspergillus</i> spp. Sono responsabili della produzione di > 30% di tutti gli enzimi prodotti industrialmente."; |
− | fact_6 ="Le entrate annue totali degli enzimi prodotti dagli Aspergillus spp. È di 480 milioni di USD all’anno [3]."; | + | fact_6 ="Le entrate annue totali degli enzimi prodotti dagli <i>Aspergillus</i> spp. È di 480 milioni di USD all’anno [3]."; |
fact_7 ="Nel registro iGEM, meno del 5% dei promotori registrati provengono da funghi filamentosi."; | fact_7 ="Nel registro iGEM, meno del 5% dei promotori registrati provengono da funghi filamentosi."; | ||
Line 1,446: | Line 1,448: | ||
} | } | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | function setnorwegianwords(){ | ||
+ | |||
+ | |||
+ | //Description text: | ||
+ | |||
+ | the_forgotten ="Det finnes flere promotør-bibliotek for bakterier og erkaryote organismer som gjær og mammale celler, men det er ingen slike bibliotek for trådformede sopp i den vitenskapelige litteratur "; | ||
+ | |||
+ | desc_h1 ="Beskrivelse av prosjekt"; | ||
+ | |||
+ | desc_p1 ="Trådformede sopp produserer 50% av alle industrielt produserte enzymer og 10% av alle kjente bioaktive produkter. Denne multi milliard industrien er derfor en stor del av hverdagen for mange mennesker. Utover dette kan trådformede sopp også utnyttes i produksjonen av mange andre produkter (1)(2)."; | ||
+ | |||
+ | desc_p2 ="På tross at trådformede sopp er ekstremt viktig i industrien, finnes det bare en uproporsjonal liten mengde av iGEM-lag som har jobbet med denne gruppen av organismer. 2018 DTU iGEM-laget Hyphae Hackers jobbet med trådformede sopp i deres prosjekt med innså at tilgjengeligheten for deler til å jobbe med sopp var ekstremt mangelfull sammenlignet med tilgjengeligheten for bakterier og gjær.(f.eks. Escherichia coli og Saccharomyces cerevisiae)."; | ||
+ | |||
+ | desc_p3 ="I de 15 årene iGEM har eksistert har 2754 lag deltatt, men inntil sist år hadde bare 5 lag jobbet med trådformede sopp, og deres arbeid har bidratt med mindre enn 5% av de registrerte promotører i iGEM-registry."; | ||
+ | |||
+ | desc_p4 ="Mangelen på deler til trådformede sopp resulterte dermed i store vanskeligheter med å transformere soppene og for å oppnå det ønskede uttrykk for 2018 DTU iGEM laget. Det finnes flere promotør-bibliotek for bakterier og erkaryote organismer som gjær og mammale celler, men det er ingen slike bibliotek for trådformede sopp i den vitenskapelige litteratur (3). "; | ||
+ | |||
+ | desc_p5 ="Danmarks Tekniske Universitet tilbyr unike fasiliteter samt personale med stor ekspertise i arbeidet med syntetisk biologi i trådformede sopp. Avdelingen har utover dette også en fermenteringsplattform som gjør det mulig å undersøke soppen i forskjellige skalaer og forhold. Dette gjør også kontroll av pH og overvåkning av CO2-produksjon under vekst mulig."; | ||
+ | |||
+ | desc_p6 ="Promotørere er essensielle for produksjonen av metabolitter, da de tillater opp- eller nedregulering av genutrykk. Mangelen på soppdeler og avdelingens ressurser inspirerte årets lag til å produsere et bibliotek av syntetiske promotører til trådformede sopp og andre eukaryote organismer. Vi utviklet en software som kan sammenligne flere forskjellige arter av <i>Aspergillus</i> for å finne konsensussekvenser og skape et bibliotek av syntetiske promotører. Biblioteket tilbyr promotører i forskjellig styrke som gir konsekvente resultater mellom partier og skalaer. "; | ||
+ | |||
+ | desc_p7 ="Som følge av samtaler med flere forskere og firmaer, har laget besluttet seg for en strategi som vil forsyne fremtidige iGEM-lag med verktøyene som kreves for å lage syntetisk biologi i <i>Aspergillus</i> samt å utfylle en mangel i den vitenskapelige litteratur, ved å gjøre vårt prosjekt brukbart i iGEM, forskning og industrien. "; | ||
+ | |||
+ | //Front page major text | ||
+ | |||
+ | front_h1 ="En verden av bioteknologi"; | ||
+ | front_p1 = "Mange hverdagsprodukter blir produsert ved bruk av mikroorganismer som trådformede sopp. Produksjonen av disse produktene blir regulert av små DNA-sekvenser som kalles promotører. Disse er nødvendige som verktøy for å optimere utbyttet av det ønskede produkt og for å minimere produksjonen av andre. "; | ||
+ | |||
+ | front_h2 ="Promotører"; | ||
+ | front_p2 ="Disse promotørene fungerer som regulatorer for genuttrykket. Tenk på det som en girkasse i en bil. Noen gir får bilen til å kjøre raskt, og andre for den til å gjøre sakte. DEtte blir gjort ved å kontrollere transkripsjonen av et gen, da det bestemmer den styrken RNA polymerasen kan binde seg med."; | ||
+ | |||
+ | front_h3 ="Vårt bibliotek"; | ||
+ | front_p3 ="Derfor lager vi et bibliotek av syntetiske sopp-promotører som er: forutsigbare, robuste og skalerbar. Promotørene ble designet ved bruk av særskilt software basert på bevarede sekvenser. I designet har vi inkludert feedback fra relevante firmaer og forskere, hvilket betyr at promotørene er brukbare i industrien så vel som i forskningsverdenen."; | ||
+ | |||
+ | //alt text for the blind: | ||
+ | |||
+ | leap ="Library of Engineered <i>Aspergillus</i> Promoters"; | ||
+ | |||
+ | video_1 ="Videoen viser en promotør som blir innsatt en plasmid som videre blir innsatt i en sopp. Soppen kan da produsere forskjellige ingredienser til hverdagsprodukter. "; | ||
+ | |||
+ | video_2 ="Videoen viser hvordan RNA-polymerasens bindingsstyrke kan endres gjennom våre promotører, akkurat som når man skifter gir i en bil. "; | ||
+ | |||
+ | video_3 ="Videoen viser at de promotørene vi har laget i laboratoriet blir innsatt i biblioteket."; | ||
+ | |||
+ | button_1 ="Klikk her for å finne ut av hva vi gjøre for dyslektikere"; | ||
+ | |||
+ | button_2 ="Endre språket på forsiden og prosjektbeskrivelsen"; | ||
+ | |||
+ | grant_logo ="Logoene på våre tre største sponsorer, DTU BlueDot, Novo Nordisk-fonden og Otto Mønsted-fonden"; | ||
+ | |||
+ | sponsor_logo ="Logoene på alle våre sponsorer, DTU, BioNordica, Eurofins Genomics, Qiagen, NEB New England biolabs, IDT Integrated DNA technologies og Twist bioscience"; | ||
+ | |||
+ | fact="Visste du:"; | ||
+ | |||
+ | fact_1 ="Mugg finnes på flere steder enn fordervet mat. Det kan bli brukt til å produsere mange hverdagsgjenstander som enzymer til vaskepulver og tilsetningsstoffer."; | ||
+ | |||
+ | fact_2 ="Det er ca. 5,1 millioner forskjellige sopparter."; | ||
+ | |||
+ | fact_3 ="<i>Aspergillus niger</i> produserer >99% av all sitronsyre som blir solgt."; | ||
+ | |||
+ | fact_4 ="Halvdelen av alle industrielt produserte enzymer blir produsert av trådformede sopp."; | ||
+ | |||
+ | fact_5 ="<i>Aspergillus</i> arter står for produktionen av >30% av alle industrielt produserte enzymer."; | ||
+ | |||
+ | fact_6 ="Den samlede årlige omsetning fra enzymer produseres av <i>Aspergillus</i>-arter er 480 millioner USD [3]."; | ||
+ | |||
+ | fact_7 ="I iGEM registry er mindre enn 5% av de registrerte promotørene trådformede sopp."; | ||
+ | |||
+ | //Description links | ||
+ | |||
+ | link_model ="Link til model"; | ||
+ | link_design ="Design"; | ||
+ | link_attri ="Attribusjoner"; | ||
+ | link_exper ="Eksperimenter"; | ||
+ | link_hp ="Humanitære foretagende"; | ||
+ | link_resul ="Resultater"; | ||
+ | link_safety ="Sikkerhet"; | ||
+ | link_collab ="Samarbejde"; | ||
+ | link_future ="Til fremtidige iGEM lag"; | ||
+ | |||
+ | //button texts | ||
+ | |||
+ | dys_h1 ="Dysleksi"; | ||
+ | |||
+ | dys_p1 ="Vi kan ikke kurere dysleksi, men kanskje vi kan gjøre det litt lettere for deg å navigere rundt på siden. Vi har lagt til muligheten for å endre fargeskjemaet som forhåpentligvis gjør leseopplevelsen din bedre."; | ||
+ | |||
+ | dys_text_col ="Bakgrunnsfarge:"; | ||
+ | dys_back_col ="Tekstfarge:"; | ||
+ | |||
+ | visu_h1 ="For de synsskader"; | ||
+ | |||
+ | visu_p1 ="Vitenskap er ikke reservert for noen og vi har sikret oss at vår side inkluderer alle ved å følge noen sentrale aspekter for tilgjengelighet. Dette er blant annet gjort ved å forsyne samtlige bilder på denne side med en “alt”-tekst. Det vil si at et skjermlesningsprogram sikrer at alle kan oppleve vår grafikk og forstå den informasjonen som fortelles. Vi har dessuten oversatt “alt”-teksten og all annen tekst på forsiden og beskrivelsessiden."; | ||
+ | |||
+ | visu_p2 ="Om du er interessert i å gjøre din egen side mer tilgjengelig, kan du klikke nedenfor og lese vår guide for å inkludere de synsskader, fargeblinde, og folk med dårlig hørsel."; | ||
+ | |||
+ | visu_click ="Klikk her"; | ||
+ | |||
+ | // pies | ||
+ | |||
+ | pie_1 ="Dette kakediagrammet viser at 49% av alle industrielt produserte enzymer blir produsert av trådformede sopp, 2% av gjær, 27% av blandede bakterier og 22% av andre."; | ||
+ | |||
+ | pie_2 ="Dette kakediagrammet viser at av alle promotørene i iGEM-regestery, er 79% fra <i>E. Coli</i>, 1.75% fra <i>B. Subtilis</i>, 4.50% fra bakteriophager, 2.25% fra blandede prokaryoter, 8% fra gjær og 4.5% fra blandede eukaryoter."; | ||
+ | |||
+ | |||
+ | } | ||
+ | |||
+ | |||
+ | function setarabicwords(){ | ||
+ | |||
+ | //Description text: | ||
+ | |||
+ | the_forgotten =""; | ||
+ | |||
+ | desc_h1 ="وصف المشروع"; | ||
+ | |||
+ | desc_p1 ="الفطريات الخيطية هي المسؤولة عن 50 ٪ من جميع الإنزيمات المنتجة صناعيا و 10 ٪ من جميع المركبات النشطة بيولوجيا المعروفة ، وبالتالي هذه الصناعة بمليارات الدولارات هي جزء كبير من الحياة اليومية. ومع ذلك ، في حين أن هذا أمر مثير للإعجاب ، يمكن استخدام .(1)(2)الفطريات الخيطية في إنتاج العديد من المركبات الأخر "; | ||
+ | |||
+ | desc_p2 ="في حين أن الفطريات الخيطية مهمة للغاية في الصناعة ، فقد عمل عدد قليل بشكل غير متناسب من فر iGEM مع هذه المجموعة من الكائنات الحية قام فريق Hyphae Hackers لفريق 2018 DTU iGEM باستغلال الفطريات الخيطية في مشروعهم ، ولكنه أدرك أن إمكانية الوصول إلى الأجزاء تفتقر بشدة إلى تلك الموجودة في البكتيريا والخمائر (مثل الإشريكية القولونية وخلايا الساكروميس)."; | ||
+ | |||
+ | desc_p3 ="خلال 15 عامًا من مشاركة iGEM ، شارك 2754 فريقًا ، لكن حتى العام الماضي كان 5 فقط منهم قد عملوا في الفطريات الخيطية ، وكان هؤلاء يمثلون أقل من 5٪ من المروجين في سجل. iGEM."; | ||
+ | |||
+ | desc_p4 ="وبالتالي أدى عدم وجود أجزاء فطرية خيطية إلى صعوبات كبيرة لفريق 2018 DTU iGEM مع تحويل الفطريات وتحقيق التعبير المطلوب. في حين توجد العديد من المكتبات المعززة للبكتيريا والكائنات الحية حقيقية النواة مثل الخميرة وخلايا الثدييات ، لا توجد حاليًا .(3)مكتبات من هذا القبيل للفطريات الخيطية في الأدبيات العلمية "; | ||
+ | |||
+ | desc_p5 ="تضم الجامعة التقنية في الدنمارك مرافق فريدة وموظفين يتمتعون بخبرة كبيرة في العمل مع البيولوجيا التركيبية في الفطريات الخيطية. علاوة على ذلك ، يوجد في القسم نواة تخمير تتيح فحص الفطريات في نطاقات متعددة وتحت ظروف مختلفة بالإضافة إلى التحكم في درجة الحموضة ومراقبة إنتاج ثاني أكسيد الكربون أثناء النمو."; | ||
+ | |||
+ | desc_p6 ="المروجون ضروريون في إنتاج المستقلبات ، حيث يسمحون بتنظيم التعبير الجيني لأعلى أو لأسفل. ألهم قلة الأجزاء الفطرية بالإضافة إلى موارد القسم فريق هذا العام لإنتاج مكتبة من المروجين الاصطناعية للفطريات الخيطية وغيرها من الكائنات حقيقية النواة. لإنشاء المكتبة ، قمنا ببناء برنامج يقوم بمقارنة جينومات العديد من الأنواع المختلفة من <i>Aspergillus</i> لتحديد الحفاظ على التسلسل وإنشاء مكتبة من المروجين الاصطناعية. توفر المكتبة المروجين من نقاط القوة المختلفة التي تعطي نتائج متسقة وقابلة للتكرار بين الدُفعات والمقاييس."; | ||
+ | |||
+ | desc_p7 ="بعد مناقشات مع العديد من العلماء والشركات ، قرر الفريق وضع إستراتيجية تزود فرق iGEM المستقبلية بالأدوات اللازمة للقيام بالبيولوجيا التركيبية في <i>Aspergillus</i> بالإضافة إلى سد الفجوة في الأدب العلمي ، مما يجعل مشروعنا مفيدًا في iGEM والأوساط الأكاديمية والصناعة."; | ||
+ | |||
+ | //Front page major text | ||
+ | |||
+ | |||
+ | front_h1 ="عالم التكنولوجيا الحيوية"; | ||
+ | front_p1 ="يتم إنتاج العديد من المنتجات اليومية باستخدام الكائنات الحية الدقيقة مثل الفطريات. يتم تنظيم إنتاج هذه المنتجات من خلال تسلسل الحمض النووي صغير يسمى المروجين. هذه أدوات ضرورية لتحسين إنتاجية المنتج المرغوب وتقليل إنتاجية الآخرين." | ||
+ | |||
+ | front_h2 ="المروجين"; | ||
+ | front_p2 ="هؤلاء المروجين يعملون كمنظمين للتعبير الجيني. فكر في الأمر كعلبة تروس في السيارة. بعض التروس تجعل السيارة تسير بسرعة ، .RNA والبعض الآخر يقلل السرعة. يتم ذلك عن طريق التحكم في نسخ الجينات ، حيث إنها تحدد القوة التي يمكن أن يرتبط بها بوليميريز"; | ||
+ | |||
+ | front_h3 ="مكتبتنا"; | ||
+ | front_p3 ="لذلك ، نحن بصدد إنشاء مكتبة من المروجين الفطريات الاصطناعية التي هي: يمكن التنبؤ بها ، قوية ، وقابلة للتطوير. تم تصميم هذه باستخدام برنامج خاص يعتمد على حفظ التسلسل. في التصميم ، قمنا بتضمين ملاحظات من الشركات والعلماء المعنيين ، مما يعني أن المروجين مفيدون في كل من الصناعة والأوساط الأكاديمية."; | ||
+ | |||
+ | //alt text for the blind: | ||
+ | leap ="Library of Engineered <i>Aspergillus</i> Promoters"; | ||
+ | |||
+ | video_1 ="يُظهر الفيديو مروجًا يجري إدخاله في بلازميد ، يتم إدراجه بعد ذلك في الفطريات. يمكن للفطريات بعد ذلك إنتاج مكونات مختلفة للمشاريع المنزلية."; | ||
+ | |||
+ | video_2 ="يُظهر الفيديو كيف يمكن تغيير قوة الربط الخاصة بوليميريز الحمض النووي الريبي من خلال مروّجينا مثل تغيير التروس على السيارة."; | ||
+ | |||
+ | video_3 ="يُظهر الفيديو أن المروجين الذين أنشأناهم في المختبر قد تم إدراجهم في مكتبة."; | ||
+ | |||
+ | button_1 ="انقر هنا لمعرفة ما فعلناه للأشخاص الذين يعانون من عسر القراءة"; | ||
+ | |||
+ | button_2 =""; | ||
+ | |||
+ | |||
+ | grant_logo =""; | ||
+ | |||
+ | sponsor_logo =""; | ||
+ | |||
+ | fact =""; | ||
+ | |||
+ | fact_1=""; | ||
+ | |||
+ | fact_2=""; | ||
+ | |||
+ | fact_3=""; | ||
+ | |||
+ | fact_4=""; | ||
+ | |||
+ | fact_5=""; | ||
+ | |||
+ | fact_6=""; | ||
+ | |||
+ | fact_7=""; | ||
+ | |||
+ | //Description links | ||
+ | |||
+ | link_model =""; | ||
+ | link_design = ""; | ||
+ | link_attri =""; | ||
+ | link_exper =""; | ||
+ | link_hp =""; | ||
+ | link_resul=""; | ||
+ | link_safety=""; | ||
+ | link_collab=""; | ||
+ | link_future=""; | ||
+ | |||
+ | |||
+ | //button texts | ||
+ | |||
+ | dys_h1=""; | ||
+ | |||
+ | dys_p1=""; | ||
+ | |||
+ | dys_text_col=""; | ||
+ | dys_back_col=""; | ||
+ | |||
+ | visu_h1=""; | ||
+ | |||
+ | visu_p1=""; | ||
+ | |||
+ | visu_p2=""; | ||
+ | |||
+ | visu_click =""; | ||
+ | |||
+ | // pies | ||
+ | |||
+ | pie_1=""; | ||
+ | |||
+ | pie_2=""; | ||
+ | |||
+ | } | ||
+ | |||
+ | function setrussianwords(){ | ||
+ | |||
+ | //Description text: | ||
+ | |||
+ | |||
+ | the_forgotten ="Хотя существует несколько библиотек промоторов для бактерий и эукариотических организмов, таких как дрожжи и клетки млекопитающих, в научной литературе в настоящее время нет аналогичных библиотек для нитчатых грибов"; | ||
+ | |||
+ | desc_h1 ="Описание проекта"; | ||
+ | |||
+ | desc_p1 ="На нитчатые грибы приходится 50% всех промышленно производимых ферментов и 10% всех известных биоактивных соединений, поэтому эта многомиллиардная индустрия является важной частью нашей повседневной жизни. Хотя это и впечатляет, нитчатые грибы могут быть также использованы для производства многих других новых биологических соединений (1)(2)."; | ||
+ | |||
+ | desc_p2 ="Несмотря на то, что нитчатые грибы чрезвычайно важны в промышленности, с этой группой организмов работало непропорционально малое число команд iGEM. В 2018 году команда DTU iGEM Hyphae Hackers использовала нитчатые грибы в своем проекте, но быстро поняла, что доступность частей для нитчатых грибов сильно отсутствует по сравнению с аналогичной доступностью для бактерий и дрожжей (например, Escherichia coli и Saccharomyces cerevisiae)."; | ||
+ | |||
+ | desc_p3 ="За 15 лет существования iGEM в нем приняли участие 2754 команды, но до прошлого года только 5 из них работали с нитчатыми грибами, и на их долю приходилось менее 5% промотеров в реестре iGEM."; | ||
+ | |||
+ | desc_p4 ="Поэтому отсутствие частей нитчатых грибов привело к большим трудностям для команды DTU iGEM в 2018 году с преобразованием грибов и достижением желаемой экспрессии генов. Хотя существует несколько библиотек промоторов для бактерий и эукариотических организмов, таких как дрожжи и клетки млекопитающих, в научной литературе в настоящее время нет аналогичных библиотек для нитчатых грибов (3)."; | ||
+ | |||
+ | desc_p5 ="Технический университет Дании располагает уникальными возможностями и персоналом с большим опытом работы в области синтетической биологией вообще и нитчатый грибах в частности. Кроме того, в департаменте имеется отдел ферментации, который позволяет исследовать грибы в разных масштабах и в разных условиях, а также контролировать pH и выработку CO2 во время роста грибов."; | ||
+ | |||
+ | desc_p6 ="Промоторы играют важную роль в выработке метаболитов, поскольку они позволяют повышать или понижать регуляцию экспрессии генов. Нехватка грибковых частей, а также ограниченность ресурсов департамента вдохновили команду этого года на создание библиотеки синтетических промоторов для нитчатых грибов и других эукариотических организмов. Чтобы создать библиотеку, мы подготовили программное обеспечение, которое сравнивало геномы нескольких разных видов <i>Aspergillus</i> для определения сохранения последовательности и создавало библиотеку синтетических промоторов. Библиотека предоставляет промотеры различной активности, которые дают согласованные и воспроизводимые результаты между группами разных масштабов."; | ||
+ | |||
+ | desc_p7 ="После обсуждения с несколькими учеными и компаниями команда определила стратегию, которая обеспечит инструментами будущие команды iGEM, необходимыми для синтетической биологии с <i>Aspergillus</i>, а также устранит пробел в научной литературе, что сделает наш проект полезным для iGEM, научных кругов и промышленности."; | ||
+ | |||
+ | //Front page major text | ||
+ | |||
+ | front_h1 ="Мир биотехнологий"; | ||
+ | |||
+ | front_p1 ="Многие повседневные продукты производятся с использованием микроорганизмов, таких как грибы. Производство этих продуктов регулируется небольшими последовательностями ДНК, называемыми промоторами. Это необходимые инструменты для оптимизации экспрессии желаемого продукта и минимизации других."; | ||
+ | |||
+ | front_h2 ="Промотеры"; | ||
+ | |||
+ | front_p2 ="Промотеры работают в качестве регуляторов для экспрессии генов, аналогично коробке передач в автомобиле. Некоторые механические передачи заставляют автомобиль двигаться быстрее, а другие снижают скорость. Аналогично промотеры контролирует транскрипцию гена, поскольку они определяет силу связи РНК-полимеразы с ДНК."; | ||
+ | |||
+ | front_h3 ="Наша библиотека"; | ||
+ | |||
+ | front_p3 ="Поэтому мы создаем библиотеку синтетических грибковых промоторов, которые являются предсказуемы, надежны и масштабируемы. Они были разработаны с использованием специального программного обеспечения на основе поиска сохранения последовательности. В дизайн библиотеки мы включили отзывы от соответствующих компаний и ученых, что обеспечивает то что просмотрел будут полезны как в промышленности, так и в научных интересах."; | ||
+ | |||
+ | //alt text for the blind: | ||
+ | leap = "Library of Engineered <i>Aspergillus</i> Promoters"; | ||
+ | |||
+ | video_1 ="Видео показывает, что промотор вставляется в плазмиду, которая затем внедрятся в клетку гриба. Затем гриб может производить различные ингредиенты для прикладных нужд."; | ||
+ | |||
+ | video_2 ="Видео показывает, как сила связи РНК-полимеразы может регулироваться с помощью наших промотеров, аналогично переключению передач на автомобиле."; | ||
+ | |||
+ | video_3 ="Видео показывает, что промотеры, которые мы создали в лаборатории, добавляются в библиотеку."; | ||
+ | |||
+ | button_1 ="Нажмите здесь, чтобы узнать, что мы сделали для людей с дислексией"; | ||
+ | |||
+ | button_2 ="Измените язык главной страницы и страницы описания"; | ||
+ | |||
+ | grant_logo ="Логотипы трех наших крупнейших спонсоров, DTU Blue Dot, фонда Novo Nordisk и фонда Otto Mønsted"; | ||
+ | |||
+ | sponsor_logo ="Логотипы всех наших спонсоров, DTU, BioNordica, Eurofins Genomics, Qiagen, NEB, NEB New England biolabs, IDT Integrated DNA technologies и Twist bioscience"; | ||
+ | |||
+ | fact ="Знали ли вы:"; | ||
+ | |||
+ | fact_1 ="Плесень не только содержится в испорченных продуктах, но и используется для производства многих повседневных веществ, таких как ферменты для добавок в стиральный порошок."; | ||
+ | |||
+ | fact_2 ="Существует около 5,1 миллиона различных видов нитчатых грибов."; | ||
+ | |||
+ | fact_3 ="<i>Aspergillus niger</i> производит более 99% всей лимонной кислоты."; | ||
+ | |||
+ | fact_4 ="Половина промышленных ферментов производится нитевидными грибами."; | ||
+ | |||
+ | fact_5 ="<i>Aspergillus</i> spp. ответственны за производство более 30% всех промышленных ферментов."; | ||
+ | |||
+ | fact_6 ="Общий годовой доход от ферментов, производимых используя <i>Aspergillus</i> spp. составляет 480 миллионов долларов США в год [3]."; | ||
+ | |||
+ | fact_7 ="В реестре iGEM менее 5% зарегистрированных промоторов происходят из нитчатых грибов."; | ||
+ | |||
+ | //Description links | ||
+ | |||
+ | link_model ="Ссылка на модель"; | ||
+ | link_design ="дизайн"; | ||
+ | link_attri ="Атрибуции"; | ||
+ | link_exper ="Эксперименты"; | ||
+ | link_hp ="Человеческие практики"; | ||
+ | link_resul ="Результаты"; | ||
+ | link_safety ="Безопасность"; | ||
+ | link_collab ="Сотрудничество"; | ||
+ | link_future ="Для будущих команд iGEM"; | ||
+ | |||
+ | //button texts | ||
+ | |||
+ | dys_h1 ="Дислексия"; | ||
+ | |||
+ | dys_p1 ="Мы не можем вылечить дислексию, но, возможно, мы можем немного облегчить вам навигацию по странице. Мы добавили возможность немного изменить цветовую гамму, которая поможет вам облегчит чтения."; | ||
+ | |||
+ | dys_text_col ="Цвет фона:"; | ||
+ | dys_back_col ="Цвет текста:"; | ||
+ | |||
+ | visu_h1 ="Для слабовидящих"; | ||
+ | |||
+ | visu_p1 ="Наука не предназначена для избранной группы, и мы надеемся, что наша страница охватывает всех, следуя нескольким ключевым аспектам доступности, например, предоставляя каждому изображению на этой странице текст «alt», что означает, что программа чтения с экрана позаботится о том, чтобы каждый мог наслаждаться нашей графикой и получать точную информацию которую они передают. Мы также позаботились о том, чтобы перевести «alt» -текст вместе со всем другим текстом на первой странице и описанием."; | ||
+ | |||
+ | visu_p2 ="Если вы заинтересованы в том, чтобы сделать свою собственную страницу более доступной, нажмите ниже и прочитайте наше простое руководство, как вовлечь людей с нарушениями зрения, дальтоников и людей с нарушениями слуха."; | ||
+ | |||
+ | visu_click ="Нажмите здесь"; | ||
+ | |||
+ | //pies | ||
+ | |||
+ | pie_1 =""; | ||
+ | pie_2 =""; | ||
+ | |||
+ | } | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
Revision as of 00:12, 22 October 2019
Our Library
Therefore we are creating a library of synthetic fungal promoters that are: predictable, robust, and scalable. These were designed using special software based on sequence conservation. In the design we have included feedback from relevant companies and scientists, meaning that the promoters are useful in both industry and academia.
The total annual revenue from enzymes produced by Aspergillus spp. is 480 mio USD per year [3].
A small step for man, a giant LEAP for iGEM
(1) M. Blackwell, “The fungi: 1, 2, 3 ... 5.1 million species?,” Am. J. Bot., vol. 98, no. 3, pp. 426–438, 2011.
(2) I. E. Sweis and B. C. Cressey, “Potential role of the common food additive manufactured citric acid in eliciting significant inflammatory reactions contributing to serious disease states: A series of four case reports,” Toxicol. Reports, vol. 5, no. August, pp. 808–812, 2018.
(3) S. Siddiqui, Protein Production: Quality Control and Secretion Stress Response. Elsevier B.V., 2016.